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DNA實驗技術(shù):T4 DNA聚合酶實驗

2013-9-4  閱讀(2310)

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標(biāo)簽: T4 DNA 聚合酶

T4 DNA 聚合酶具依賴人為模板的聚合酶活性,同時具有對單鏈、雙鏈DNA的3’到5’端的外切酶活性,缺少5’到3’端的外切酶活性。

實驗方法

  • T4 DNA聚合酶

實驗材料

DNA

試劑、試劑盒

Trish·Cl dNTP MgCl2 BSA DTT

儀器、耗材

水浴鍋

實驗步驟

一、50 μl 反應(yīng)體積:


(1)50 mmol/l  Tris·Cl,pH8.0

(2)5 mmol/l  MgCl2

(3)5mmol/l  DTT

(4)100 μmol/l  4dNTP混合液

(5)50 μg/ml  BSA

(6)0.1 U  T4DNA聚合酶

(7)2 μg  DNA

(8)11℃溫育20 min,加入2 μl 0.5 mol/l EDTA或75℃加熱10 min以終止反應(yīng)。

(9)反應(yīng)體枳、4種dNTp的濃度、反應(yīng)溫度可依具體應(yīng)用而變。

 

二、dNTp濃度的效應(yīng)

 

1.  高濃度的dNTP在通常實驗下可以增加聚合酶活性對外切酶活性的比值。

2.  在標(biāo)記實驗中,標(biāo)記了dNTP的濃度降至1到2 μmol/l,但標(biāo)記dNTP不能低于1 μmol/l 濃度,否則當(dāng)dNTP耗竭時,會導(dǎo)致其外切酶活性對的降解。

 

三、度的效應(yīng)

 

用T4 DNA聚合酶標(biāo)記3’末端時,反應(yīng)溫度保持在11℃,在較髙溫度下,其外切酶活性易降解DNA模板。

收起 
其他

一、緩沖系統(tǒng)的相容性

 

許多限制性內(nèi)切酶能在T4 DNA聚合酶的緩沖系統(tǒng)進(jìn)行切割反應(yīng),同時,T4 DNA 聚合酶也能直接使用。


二、應(yīng)用

 

1.  放射性標(biāo)記DNA段的3’末端,含5’凸出端的DNA段及濃度為1~2 μmol/l 的適當(dāng)[α-32P]dNTP,在11℃溫育20 min。

 

2.  選擇性及無選擇標(biāo)記線性化雙鏈DNA分子的3’宋端,即所謂的“置換合成”。雙鏈 DNA段在dNTP存在下與T4 聚合酶溫育,其3’末瑞的外切酶活性導(dǎo)致從 3’末端降解DNA,當(dāng)補(bǔ)加4種dNTP后,可激活其聚合酶活性,延伸DNA鏌板的3’末端。在T4 DNA聚合酶的外切酶活性降解了30~40%外模板時加入4種dNTP混合液,可獲得zui隹標(biāo)記效果。

3.  變雙鏈DNA的粘性末端成平端,便于平端克隆。在髙濃度4dNTP種存在下,酶促的 降解終止于雙鏈區(qū),類似地,如果末端存在5‘凸出,酶將延伸凹進(jìn)陷的3’端直至與5’端平齊。在實際應(yīng)用中,DNA與T4 DNA聚合酶和濃度各100 μmol/l dNTP在溫育20 min。 

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