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對于液相色譜儀整個系統而言，柱子、泵和檢測器是核心部件同時也是易出問題的主要部位。作為一種高精密儀器，如果在使用過程中不按照正確操作的話，就容易導致一些問題。其中常見的就是柱壓問題、漂移問題、峰型異常問題。下面列出幾個常見故障，并附上建議，幫您排憂解難。
問題一
出現基線不平的現象，后經過沖洗正常，又出現柱塞桿漏液，換了密封圈后正常，接著測樣品時，泵發出很大的噪音，立即停止泵的運行，對泵進行了潤滑后，噪音消失，進樣后又發現峰高都特別低，又試了幾次后竟然什么峰也不出了，為什么?
建議：
1.檢查液路是否正常,保證流量,密封性都對的。
2.不接柱子進純品看看檢測器有沒有響應，如果沒有就是檢測器出問題了。
3.檢查你的樣品是不是正常的。
問題二
液相色譜六合進樣器，近堵住了，啟動泵進樣閥就開始漏液，有人說是進完樣后沒用甲醇去進樣清洗堵掉了，我想知道每次走完樣后是不是需要進幾針甲醇去清洗，而漏液什么原因?
建議：
其實要知道六通閥有沒有堵，你可以在停泵的狀態下，用有機相來清洗，如果能夠正常清洗的話，那應該沒堵；如果溶劑打不進去，那應該是堵了，或者你可以看看漏液的地方是不是有螺絲松了。
問題三
使用液相色譜，將一個樣品連進六針，峰面積差異很大，忽高忽低，這是為什么?
建議：
1、進樣器有的時候會出現氣泡，如果此時連續進一個樣品就會出現峰面積忽高忽低，多做幾次purgeinjector就OK了。
2、用標準品試一下看是不是樣品的問題；然后再看看柱壓柱溫、流速、進樣器、氘燈有沒有問題。
3、查看定量環是否有氣泡。
4、進樣的六通閥、色譜柱接口、泵至色譜柱接口的管路中是否有泄漏現象。其實說到底一般是兩種情況，要么是樣品的原因，要么是儀器原因。如果是樣品，建議換一下其他物質試一下；如果是儀器原因，可能是進樣器、定量環、比例閥等等問題。
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