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質譜法是測量離子的荷質比的分析方法，其基本原理是在離子源中使樣品中的各組分電離，產生不同荷質比的帶正電離子。加速電場作用后，形成離子束，進入質量分析器。在氣相色譜質譜聯用儀中，利用電場和磁場產生相反的速度色散，分別聚焦得到質譜，從而確定它們的質量。
氣相色譜質譜聯用儀用于醫學和物理，氣相色譜的流動相為惰性氣體，在氣固色譜中采用大比表面積和一定活性的吸附劑作為固定相。當多組分混合樣品進入色譜柱時，由于吸附劑對各組分的吸附能力不同，一定時間后各組分在色譜柱中的運行速度會有所不同。吸附能力弱的成分容易解吸，離開色譜柱*入檢測器，而吸附能力*的成分最不容易解吸，最后離開色譜柱。這樣，各組分就可以在色譜柱中相互分離，依次進入檢測器進行檢測和記錄。
1、氣相色譜分離能力強；
2、質譜對未知化合物具有*的識別能力，靈敏度高，因此GC-MS是分離檢測復雜化合物的有力工具之一；
3、系統生態運行模式，可減少儀器待機時不必要的電能和載氣消耗；
4、實時采集功能提供全掃描和選擇性離子掃描的數據采集，可以獲得準確的定性和定量結果數據。
氣相色譜質譜聯用儀是一種結合GC和MS的特點對樣品中不同物質進行鑒別的方法，主要應用于工業檢測、食品安全、環保等諸多領域。如農藥殘留、食品添加劑等；紡織品檢測，如禁用偶氮染料、氯酚檢測等化妝品檢測如二惡烷、香精香料檢測；多溴聯苯、多溴聯苯醚等電子電氣產品的檢測；各種復雜的化合物可能涉及物證的檢查。GC-MS為司法鑒定過程中復雜化合物的定性和定量分析提供了強有力的支持。
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