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與普通干燥方式相比，冷凍干燥機具有以下優點：
1、許多熱敏物質不會變性或失活。
2、低溫干燥時，物料中一些揮發性成分的損失很小。
3、在凍干過程中，微生物的生長和酶的作用不能進行，所以可以保持原有的性質。
4、由于在冷凍狀態下干燥，體積幾乎不變，保持原有結構，不會出現濃縮現象。
5、由于物料中的水分在預凍后以冰晶的形式存在，原來溶解在水中的無機鹽的溶解物質均勻分布在物料中。在升華過程中，溶解在水中的溶解物質會沉淀出來，避免了一般干燥方法中由于材料中的水分遷移到表面而導致無機鹽在表面析出而導致表面硬化的現象。
6、干燥后的物料松散、多孔、海綿狀。加水后迅速*溶解，幾乎立即恢復其原有性質。
7、由于干燥是在真空下進行，氧氣少，保護了一些易氧化的物質。
8、烘干可去除95%～99%以上的水分，使烘干后的產品可以長期保存而不變質。
冷凍干燥機容量應根據企業生產規模或實驗需要選擇。凍干機一般分為三個系列：實驗系列、中試型和生產系列。每個系列都有不同尺寸和比例的模型。
1、實驗室系列凍干機主要用于科學研究。它們的冷凍干燥能力非常小。每批冷凝器的冷凍量小于10kg，凍干箱板面積小于0.5m2。部分實驗室凍干機的凍干箱為鐘罩式或多歧管式。
2、中試規模和小規模生產系列用于擴大試驗和小規模生產。冷凝器的冷凍量在每批10-40kg之間，凍干箱的板面積在0.5-2m2之間。
3、生產型系列凍干機用于工業大批量生產。冷凝器的冷凍體積在每批40-1600公斤之間，凍干箱的板面積在3-80平方米之間。
用戶應根據自己的生產能力決定選擇哪種類型的冷凍干燥機，部分數據可以通過計算確定。例如，對于每批液體體積為200公斤（L）的產品進行凍干，應首先選擇冷凝器冷凍體積不小于200公斤（L）的凍干機。然后計算凍干箱板層的承載面積。面積的計算與產品的裝載方式有關，板法和瓶法的面積不一定相同。板式包裝法充分利用了板層的面積，而瓶裝法由于沒有充分利用瓶子之間的間隙，需要較大的板層面積。
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