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數字PCR是一種核酸檢測和定量的新方法。同傳統PCR以及qPCR相比，增加了一步分液的操作，將幾十微升的已經配好的包含有引物、模板、buffer、酶等組分的PCR反應體系分隔成了眾多微小的、獨立的反應體系，這樣能夠直接數出DNA分子的個數，對起始樣品定量，通過將一個樣本分成幾萬到幾百萬份，分配到不同的反應單元，每個單元包含一個或多個拷貝的目標分子( DNA 模板) ，在每個反應單元中分別對目標分子進行PCR擴增，擴增結束后對各個反應單元的熒光信號進行統計學分析。如下圖：
PCR 運行可以分為三個階段：
指數期
每個循環積聚的產物準確加倍(假定 100% 反應效率)。該反應具有高度特異性和準確度。出現指數式擴增，因為所有試劑均新鮮可用，反應的動力學推動反應有利于擴增子加倍。
線性期(高變異性)
隨著反應繼續，一些試劑因擴增而被消耗。反應開始減緩，并且每個循環的 PCR 產物不再加倍。
平臺期(終點：使用傳統方法進行凝膠檢測)
反應停止，不再產生更多產物，并且如果放置時間夠長，PCR 產物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應動力學，所以每支試管或每個反應將在不同的時間點進入平臺期。在平臺期可以看到這些差異。在平臺期內，傳統 PCR 進行測量，又稱為終點檢測。
數字PCR檢測的是游離DNA，采血管為游離DNA管，采樣5-10ml。檢測過程包括核酸提取、芯片制備、PCR擴增、芯片閱讀、結果分析，實現全程基本自動化、封閉式操作，避免污染。無需培養，節省時間；高靈敏度，提高檢出率；多色熒光檢測，一管血可檢測23個靶標，節省寶貴樣本，幫助解決“檢出率低”和“檢測周期長”兩大痛點，達到早期診斷、療效監測的目的。
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