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中國農(nóng)大期刊發(fā)表CRISPR2015/07/25

通過CRISPR/Cas9基因組編輯系統(tǒng)的組成型過量表達(dá)而產(chǎn)生的擬南芥突變體，通常在T1代是嵌合體。七月二十一日，來自中國農(nóng)業(yè)大學(xué)的研究人員在生物學(xué)期刊《GenomeBiology》發(fā)表的一項研究中，利用卵細(xì)胞特異性的啟動子，來驅(qū)動Cas9的表達(dá)，并以很高的效率獲得了多個靶基因的非嵌合性T1突變體。延伸閱讀：用CRISPR編輯樹木基因組。本文通訊作者是中國農(nóng)業(yè)大學(xué)植物生理學(xué)與生物化學(xué)國家重點實驗室的陳其軍博士，其2002年在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)獲博士學(xué)位，2004年9月起在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院從事教學(xué)及

中國農(nóng)大期刊發(fā)表CRISPR研究2015/07/25

通過CRISPR/Cas9基因組編輯系統(tǒng)的組成型過量表達(dá)而產(chǎn)生的擬南芥突變體，通常在T1代是嵌合體。七月二十一日，來自中國農(nóng)業(yè)大學(xué)的研究人員在生物學(xué)期刊《GenomeBiology》發(fā)表的一項研究中，利用卵細(xì)胞特異性的啟動子，來驅(qū)動Cas9的表達(dá)，并以很高的效率獲得了多個靶基因的非嵌合性T1突變體。延伸閱讀：用CRISPR編輯樹木基因組。本文通訊作者是中國農(nóng)業(yè)大學(xué)植物生理學(xué)與生物化學(xué)國家重點實驗室的陳其軍博士，其2002年在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)獲博士學(xué)位，2004年9月起在中國農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院從事教學(xué)及

超越NGS的基因組分析新策略2015/07/08

來自西奈山Icahn醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們開發(fā)了一種新方法，通過結(jié)合高通量的DNA測序及基因組作圖構(gòu)建出幾近完整的基因組。這一方法使得研究人員能夠檢測復(fù)雜的基因組變異形式——由于與人類疾病有關(guān)聯(lián)這些基因組變異極為重要，然而以往卻難以檢測到它們。這項研究發(fā)布在6月29日的《自然方法》（NatureMethods）雜志上。傳統(tǒng)的下一代測序(NGS)技術(shù)能夠地檢測到某些類型的變異，如單核苷酸變異和小片段插入及缺失，但卻錯過與人類疾病相關(guān)的許多大的或復(fù)雜的基因組變異，從前的這些方法不太適合于*地從頭分析基因組

發(fā)表論文的捷徑？線粒體測序論文太多2015/07/08

DavidRoySmith是來自加拿大韋仕敦大學(xué)的一位生物學(xué)助理教授，近期他在TheScientist雜志上發(fā)文，指出目前涌現(xiàn)了太多線粒體基因組測序論文，2014年GenBank中新增的線粒體基因組序列信息多達(dá)上千條，這幾乎比上一年激增了15%。Smith指出，很少有人會質(zhì)疑這些線粒體DNA(mtDNA)作為一種遺傳標(biāo)記的有效性，但是顯而易見，mtDNA測序已經(jīng)成為了通過同行評審發(fā)表論文的一種捷徑。這些關(guān)于線粒體基因組的論文的意義何在？mtDNA序列能直接進(jìn)入GenBank嗎？從線粒體基因組數(shù)據(jù)

安徽農(nóng)科院用CRISPR編輯水稻基因2015/06/27

CRISPR/Cas9系統(tǒng)逐漸成為作物育種的一種重要基因組編輯工具。雖然已有研究證明，目標(biāo)突變可以傳遞給下一代，但是它們的遺傳方式尚未*闡明。六月十九日，安徽省農(nóng)科院的研究人員在Nature子刊《ScientificReports》發(fā)表題為“Generationofinheritableａnd“transgeneclean”targetedgenome-modifiedriceinlatergenerationsusingtheCRISPR/Cas9system”的學(xué)術(shù)論文，描述了CRISPR/

生物鐘是怎樣設(shè)定的2015/06/27

*，為了適應(yīng)地球自轉(zhuǎn)引起的晝夜改變（尤其是光強(qiáng)和溫度），地球生物會通過生物鐘調(diào)控自己的活動。生物鐘周期與地球自轉(zhuǎn)周期相符，大約是24小時。那么，這個周期到底是怎樣決定并執(zhí)行下來的呢？日本分子科學(xué)研究所(IMS)的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)，地球的自轉(zhuǎn)周期（24小時）銘刻在生物鐘蛋白KaiC的原子結(jié)構(gòu)上。這種蛋白在藍(lán)藻中表達(dá)，是直徑10nm的小分子。這項研究于六月二十五日發(fā)表在Science雜志上，不僅有助于深入理解生物鐘的基礎(chǔ)機(jī)制，還可以幫助人們治療與異常晝夜節(jié)律有關(guān)的疾病。生物鐘一直是生物學(xué)研究的熱點領(lǐng)域，

NEJM：基因檢測的監(jiān)管引發(fā)口水戰(zhàn)2015/05/30

隨著基因組測序逐漸步入臨床，相應(yīng)的監(jiān)管也成了熱門話題。*醫(yī)學(xué)期刊《NewEnglandJournalofMedicine》近日發(fā)表了一系列文章，強(qiáng)調(diào)了臨床基因組檢測的承諾與挑戰(zhàn)，特別是美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）對這些檢測的監(jiān)管。休斯頓大學(xué)法律中心的BarbaraEvans聯(lián)合華盛頓大學(xué)的兩名研究人員發(fā)表了題為“TheFDAａndGenomicTests—GettingRegulationRight”的文章，批評了FDA對基因檢測的監(jiān)管。不過，她們的言論立即得到了FDA代表的回應(yīng)。作者認(rèn)為，

Nature：除了抗生素人類還能靠什么2015/05/30

自亞歷山大·弗萊明發(fā)現(xiàn)青霉素以來，已經(jīng)過去了八十多年。當(dāng)年一鳴驚人的抗生素如今已經(jīng)陷入困境，抗生素濫用導(dǎo)致的抗性問題成為了*難題。近年來，抗生素的效力在不斷降低，新抗生素的開發(fā)嚴(yán)重滯后。“我們需要做出改變，”葛蘭素史克的StephenBaker說。那么，除了抗生素人們還能夠用什么對抗感染呢？細(xì)菌界的殺手捕食性細(xì)菌是細(xì)菌世界的殺手，它們以其他細(xì)菌為食。人們希望利用這些細(xì)菌來治療感染，一些研究團(tuán)隊已經(jīng)開始在動物模型和體外培養(yǎng)的細(xì)胞中進(jìn)行測試。食菌蛭孤菌（Bdellovibriobacteriovor

“博士后被遣返”背后的反智魅影2015/05/09

近日，一篇題為《留美博士后找不到工作流浪街頭，被遣返回國》的文章在朋友圈瘋轉(zhuǎn)。文章講述的是一位留美博士后被遣返，我國公務(wù)人員費盡周折為她尋找家人的故事。從社會管理的角度看，這是一篇充滿正能量的文章。但這樣一篇文章，細(xì)讀起來卻怎么都不是滋味。文章描述的故事并不復(fù)雜。作者將這位博士后的經(jīng)歷描述得跌宕起伏，在美國的流浪經(jīng)歷令人唏噓。然而，讓人感到不安的是文章中流露出的反智情緒。雖然故事的真實性尚無法考證，但相信公務(wù)人員費盡周折為遣返者尋找親人的案例并不少見。之所以對這一事件大書特書，原因不僅在于主人公

加州大學(xué)博士因數(shù)據(jù)造假撤銷其《細(xì)胞代謝》論文2015/05/09

由于論文數(shù)據(jù)造假，美國加州大學(xué)舊金山分校（UniversityofCalifornia,SanFrancisco）JamesPWarne博士撤銷其發(fā)表在《細(xì)胞代謝》（CellMetabolism）上的一篇論文。該論文主要研究肝臟中瘦素的作用，《細(xì)胞代謝》發(fā)布通告稱，美國科研誠信辦公室（theOfficeofResearchIntegrity）認(rèn)定論文中部分?jǐn)?shù)據(jù)造假，同時JamesPWarne博士承認(rèn)為造假的數(shù)據(jù)負(fù)責(zé)。鑒于此，論文的作者們要求撤稿并對此引起的不良影響表示歉意。該論文的作者提出，盡管

罕見病診斷的新思路2015/04/11

罕見病的診斷和治療一直都是難題，而測序技術(shù)的出現(xiàn)則帶來了一絲曙光。一般來說，患者出現(xiàn)一些癥狀后，通常先看醫(yī)生，然后開展外顯子組測序，并借助研究人員，找到分子機(jī)制。然而，根據(jù)《美國醫(yī)學(xué)會雜志》（JAMA）上的一篇文章，這個順序現(xiàn)在反過來了。文章講述了一個荷蘭男孩的故事。他叫VincentPieterse，出生在2002年底。在嬰兒時期，他似乎很健康，不過隨著他漸漸長大，出現(xiàn)了學(xué)習(xí)障礙、輕微自閉癥、肌張力低下等癥狀，這表明他可能患有遺傳綜合征。不過，神經(jīng)系統(tǒng)疾病和染色體異常的檢測結(jié)果均為陰性，而家族

指揮癌細(xì)胞的復(fù)雜信號網(wǎng)絡(luò)2015/04/11

zui近，美國耶魯大學(xué)和約翰霍普金斯大學(xué)帶領(lǐng)的一個研究小組，采用先進(jìn)的技術(shù)和一種將工程學(xué)和醫(yī)學(xué)合并的方法，編制了關(guān)于“指導(dǎo)高侵襲性癌細(xì)胞的復(fù)雜信號網(wǎng)絡(luò)”的一些zui詳細(xì)的數(shù)據(jù)。耶魯大學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)家和生物醫(yī)學(xué)工程師、耶魯大學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)研究所主任AndreLevchenko說：“這是一組非常復(fù)雜的相互作用和過程。系統(tǒng)生物學(xué)方法通過分析癌細(xì)胞如何遷移到一起，以及如何單獨響應(yīng)復(fù)雜信號，確定了這種復(fù)雜性。”四月八日在《自然通訊》（NatureCommunications）雜志上發(fā)表的一項研究中，Levch

NIBS、北大繪制線蟲RNA編輯圖譜2015/02/26

近期，由北京生命科學(xué)研究所和北京大學(xué)共同完成的學(xué)術(shù)成果“ProfilingtheRNAeditomesofwild-typeC.elegansａndADARmutants”在《GenomeResearch》雜志上公開發(fā)表。在這項研究中，研究人員采用鏈特異性RNA測序（RNA-seq）和全基因組DNA測序，繪制了BristolN2野生型線蟲和三個ADAR突變體不同發(fā)育階段的RNA編輯圖譜。本文共同通訊作者分別是北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物信息中心魏麗萍教授和北京生命科學(xué)研究所研究員董夢秋博士。RNA編

Z全面的人類表觀基因組圖譜2015/02/26

，《自然》（Nature）雜志及其旗下相關(guān)的六大期刊同時在線發(fā)表24篇科技論文，發(fā)布涉及100多種人類細(xì)胞和組織的*張表觀基因組（Epigenome）綜合圖譜。表觀基因組指的是附著在基因組上的化學(xué)標(biāo)記模式，其決定了哪些基因會被激活以及它們激活的方式及時間。由于表觀基因組調(diào)控了人體的正常發(fā)育，*表觀遺傳調(diào)控失常與從癌癥、自閉癥到心臟病等廣泛的疾病相關(guān)聯(lián)，這一巨大的數(shù)據(jù)寶庫預(yù)計將提供有關(guān)人類健康和疾病生物學(xué)大量新見解（延伸閱讀：4篇Nature文章公布重大成果：三大物種表觀基因組圖譜）。這24篇論文

同濟(jì)大學(xué)科學(xué)家PNAS解析致癌信號通路2015/01/15

來自同濟(jì)大學(xué)、南開大學(xué)等處的研究人員在新研究中證實，受損的Hipp信號可促進(jìn)Rho1–JNK依賴性的生長。這一研究發(fā)現(xiàn)發(fā)表在1月12日的《美國國家科學(xué)院院刊》（PNAS）雜志上。同濟(jì)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授、科學(xué)家薛雷（LeiXue）是這篇論文的通訊作者。其主要研究方向包括腫瘤發(fā)生的分子遺傳學(xué)機(jī)制,細(xì)胞凋亡的分子生物學(xué)機(jī)制,阿爾茨海默病的分子生物學(xué)機(jī)制,Pax基因?qū)ε咛グl(fā)育和器官形成的調(diào)控作用及機(jī)制,以及治療腫瘤遷移和神經(jīng)退行性疾病的中藥篩選。大量的研究證實，Hippo和JNK信號通路在生長調(diào)

新年癌癥研究激起巨大爭議2015/01/15

新年的伊始，一條有關(guān)大多數(shù)的癌癥病例都是由于壞運氣所致的爆炸性新聞，便占據(jù)了各大媒體的頭版頭條。那自那時起，便有許多人對這一新聞報道提出了批評意見，還有些人甚至將矛頭指向了Science雜志。*的頭條記者和新聞編輯都沒有充分地理解這項發(fā)表在1月2日Science雜志上的新研究。大多數(shù)的媒體都是以“三分之二的癌癥歸因于壞運氣”（Twothirdsofcancersareduetobadluck）或類似的標(biāo)題來進(jìn)行了新聞報道（延伸閱讀：患癌癥是運氣差？專家：是的）。一些人對報道這一統(tǒng)計數(shù)值的方式提出

吸煙引起的大腦反應(yīng)男女有別2014/12/12

zui近，耶魯大學(xué)的研究人員使用一種新的大腦成像分析方法證實，吸煙可激活一種多巴胺驅(qū)動的滿意和快感反應(yīng)，而這種反應(yīng)在男女之間是不同的。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在zui近的神經(jīng)科學(xué)主流期刊《神經(jīng)科學(xué)雜志》（TheJournalofNeuroscience），該研究使用一種PET（正電子發(fā)射斷層攝影術(shù)）掃描分析的新方法，創(chuàng)建了吸煙過程中多巴胺反應(yīng)的“電影”，證明吸煙誘導(dǎo)的多巴胺激活發(fā)生在男女不同的腦區(qū)，男性的尼古丁依賴要比女性更快。實際上，通過確定男女尼古丁依賴性的*“多巴胺信號”，來識別和理解吸煙行為性別

兩篇Nature三篇子刊：細(xì)胞重編程的那些事2014/12/12

加拿大Lunenfeld-Tanenbaum研究所牽頭的研究團(tuán)隊，日前以兩篇Nature三篇NatureCommunications的形式公布了細(xì)胞重編程研究ProjectGrandiose的成果。賽默飛蛋白生物學(xué)與分子生物學(xué)產(chǎn)品精彩*+免費試用*篇Nature文章描述了體細(xì)胞重編程得到的一種新型小鼠多能干細(xì)胞，F(xiàn)-class細(xì)胞。F-class細(xì)胞不論是形態(tài)還是分子都與之前的iPSC大不相同，能夠分化成為所有三種胚胎前體組織。在體外，F(xiàn)-class細(xì)胞比其他干細(xì)胞增殖得更快，而且具有低附著的特

Nature驚人發(fā)現(xiàn)：誰可媲美微生物組2014/11/20

來自紐約大學(xué)Langone醫(yī)學(xué)中心的微生物學(xué)家說，他們獲得了*個強(qiáng)有力的證據(jù)證實，天然存在于腸道中的病毒（他們將其稱作為“病毒組”（virome））像居住在腸道中、構(gòu)成“微生物組”（microbiome）的細(xì)菌一樣發(fā)揮了維持健康以及對抗感染的作用（延伸閱讀：Cell驚人發(fā)現(xiàn)：可遺傳的微生物組）。在歷時兩年完成的一系列小鼠試驗中，該研究小組發(fā)現(xiàn)感染常見小鼠諾如病毒(murinenorovirus,MNV)可幫助小鼠修復(fù)炎癥造成的腸組織損傷，在抗生素治療消滅微生物組后幫助恢復(fù)腸道的免疫防御。在發(fā)表于

Nature子刊：鐵死亡，細(xì)胞死亡的新模式2014/11/20

細(xì)胞死亡是一個重要的生命過程，在整個機(jī)體的生長和發(fā)育中起到了基礎(chǔ)性的作用。鐵死亡（ferroptosis）是一種新發(fā)現(xiàn)的細(xì)胞死亡模式，在形態(tài)學(xué)、生物化學(xué)和遺傳學(xué)等方面與凋亡、壞死和自噬有較大差別。鐵是人體內(nèi)含量zui高的微量元素，廣泛存在于各個組織和器官中。鐵死亡主要由鐵依賴的氧化損傷引起，涉及一系列復(fù)雜的生化反應(yīng)、基因表達(dá)和信號傳導(dǎo)。這種細(xì)胞死亡模式與小分子誘導(dǎo)的RAS腫瘤細(xì)胞死亡有關(guān)，不過人們并不清楚鐵死亡與非癌變的細(xì)胞有什么關(guān)系。NatureCellBiology雜志十一月十七日發(fā)表的一項