臭氧發生器殺菌與紫外線燈管管照射殺菌相比同樣具有特殊的*性：
1、臭氧到處滲透，沒有死角。紫外線燈管只有照射到物體表面且達到一定的照射強度標準才有殺菌效果。食品車間一般比較高大，致使紫外線燈管管照射強度遠遠不夠，特別是距離遠，照射產生很大死角，如加工案板下部等。臭氧為氣體，滲透性強，擴散性好，濃度均勻，沒有死角； 
2、殺菌速度快。紫外線燈管管照射殺菌需要較長的作用時間，一般要照射6小時以上，而符合標準濃度的臭氧只需開機1小時以上； 
3、高濕度下殺菌效果更好。 紫外線燈管管照射殺菌在環境相對濕度達到60%以上時，消毒效果急劇下降，濕度達到80%以上時反可誘使細菌復活。臭氧則相反，濕度越高，殺菌效果越好。這是由于高濕度下細胞膜膨脹變薄，其組織容易被臭氧破壞，這一特性對于食品行業中普遍存在的高濕環境特別適合； 
4、有低濃度保潔功能。紫外線燈管照射時生產人員必須離開現場，照射完成后無法用低功率的紫外線燈管照射保潔；臭氧消毒時生產人員必須離開現場，消毒完成后可以調低臭氧發生量，用符合國家衛生標準的低濃度臭氧繼續保持生產車間的空氣清潔。