HPLC在線過濾器由不銹鋼卡套、濾芯組成。卡套為手緊式，或使用的小扳手旋緊。可以反復使用。濾片臟了可以超聲清洗，不能再生時則需及時更換。鈦合金濾芯，側面包以PEEK，減小死體積，濾芯整體直徑6.35mm，篩板直徑4.60mm， 厚度2mm，孔徑1μm，死體積3.20μL，色譜柱進樣口濾芯污染可能增大柱前壓并降低柱效。由于進樣口濾芯的直徑小，微徑色譜柱堵塞成為一個值得關注的問題。為了防止堵塞，在LC系統中一直使用適當的過濾器。
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