如何確定N或C末端?檢測技術服務詳情介紹
在dànbáizhì研究中,N端(氨基末端)和C端(羧基末端)的jīngquè定義是理解dànbáizhì結構與功能的基礎步驟。無論是進行翻譯起始位點驗證、信號肽識別、翻譯后修飾研究,還是構建表達載體或開發靶向藥物,末端信息的正確注釋都至關重要。本文將系統解析N/C末端的生物學意義與實驗鑒定策略,幫助科研人員設計更jīngzhǔn的研究方案。
一、為什么要鑒定N端或C端?
dànbáizhì的兩個末端往往承載重要的功能信息與調控信號,例如:
N端可能包含信號肽、定位序列或起始殘基修飾(如乙酰化、甲酰化);
C端常涉及泛素化識別序列、酶解位點或跨膜結構域;
dànbáizhì的翻譯起始點與剪接變體差異,常常體現在N端;
某些蛋白活性依賴于N/C端的剪切或特定結構構象。
??準確識別dànbáizhì的起始和終止位點,是從序列注釋邁向功能解析的關鍵一步。
二、如何確定N端或C端?
1、質譜法(Mass Spectrometry-Based Terminomics)
質譜是目前靈敏度zuì高、通量zuì高、信息zuì豐富的末端鑒定技術,已廣泛用于各類樣本的dànbáizhì起始/終止位點解析。
?? N端鑒定策略:
陽性選擇法(Positive Selection):利用化學標記手段(如TMT、Dimethyl標簽)特異性標記天然N端,抑制中間肽段干擾;
陰性選擇法(Negative Selection):先封閉所有游離N端,酶解后僅釋放天然N端肽段供富集和鑒定。
?? C端鑒定策略:
相對復雜,通常采用羧基特異性標記劑(如2-pyridinecarboxaldehyde)與特異性酶切(如Lys-C)結合,富集C端肽段;
也可通過質譜數據中“無下游殘基”的肽段推斷終止位點。
2、Edman降解法(傳統手段)
Edman降解是化學方法逐個識別N端氨基酸的經典技術,適用于高純度蛋白樣品。但其操作復雜、通量低、不能用于Cduāncèxù,在復雜樣本和大規模分析中已被質譜法替代。
3、生物信息學預測(輔助驗證)
借助已有數據庫與算法(如SignalP、TopFIND、Gencode),可預測信號肽剪切位點、翻譯起始點或C端結構域位置。但需注意:
預測工具只能作為參考,無法代替實驗數據;
建議結合質譜數據進行聯合注釋,以提高注釋準確性與生物學解釋力。
三、實驗設計注意事項
為了提升N/C端鑒定的準確性與覆蓋率,建議在實驗設計中考慮以下因素:
樣本處理:避免末端降解,采用yìtàiméi預處理;
蛋白酶選擇:使用Lys-C、Glu-C等切割特異性強的酶,有助于末端肽段保留;
數據分析策略:構建定制數據庫、啟用非典型起始位點搜索、整合翻譯后修飾位點信息;
富集策略匹配研究目標:根據項目重點選擇陽性/陰性選擇策略或不同修飾標簽。
四、N/C端信息如何應用于科研或產業?
翻譯起始位點確認:用于驗證不同剪接體或可變起始密碼子;
信號肽與定位序列識別:支持膜蛋白、分泌蛋白功能研究;
藥物靶點設計與抗體修飾:確保修飾位點不干擾功能區域;
蛋白降解通路解析:識別泛素化、N-degron等末端信號結構;
重組蛋白表達驗證:確認表達產物是否完整、起止位點是否準確。
確定dànbáizhì的N端與C端,不僅是基本結構注釋的需求,更關乎功能解析、機制研究乃至臨床開發。選擇合適的實驗策略、平臺能力與數據分析流程,將直接決定末端信息的解讀深度。作為zhuānyè的蛋白組學服務提供者,百泰派克生物科技結合豐富的項目經驗與高性能儀器平臺,致力于為科研人員提供高覆蓋、高精度的dànbáizhìN/Cduāncèxù服務,加速科學問題的深入解析。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!