基于LC-MS的無標記定量蛋白質組學：高效鑒定與定量分析檢測技術服務詳情介紹

在生命科學研究中，全面、準確地揭示dànbáizhì的表達變化對于理解生物過程和疾病機制至關重要。無biāojìdìng量dànbáizhì組學（Label-Free Quantitative Proteomics, LFQ）憑借其靈活性高、樣本需求少、成本較低等優(yōu)勢，正逐漸成為dànbáizhì定量分析的重要手段。液相色譜-質譜聯(lián)用技術（LC-MS）作為核心平臺，為無biāojìdìng量提供了高通量、定量準確的技術支撐。本文將系統(tǒng)介紹基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學的基本原理、技術流程及其在高效鑒定與定量分析中的應用優(yōu)勢。

一、無biāojìdìng量dànbáizhì組學概述

無biāojìdìng量方法通過直接比較不同樣本中肽段離子峰的強度或譜數(shù)，推測dànbáizhì的相對含量變化。常用的無biāojìdìng量策略包括基于峰面積積分（Intensity-based Quantification）和基于譜計數(shù)（Spectral Counting）。與biāojìdìng量（如TMT、iTRAQ）相比，無biāojìdìng量省去了昂貴的標記步驟，適合樣本數(shù)量多、異質性高的研究場景。

二、LC-MS在無biāojìdìng量中的核心作用

1、高分辨率分離與檢測

液相色譜（LC）能夠高效分離復雜dànbáizhì消化液中的多肽組分，極大提高了質譜（MS）檢測的動態(tài)范圍與靈敏度。現(xiàn)代高分辨率質譜儀，如Orbitrap和Q-TOF平臺，能夠提供亞ppm級的質量準確度和優(yōu)異的重復性，確保定量結果的可靠性。

2、數(shù)據(jù)采集模式：DDA與DIA

（1）數(shù)據(jù)依賴采集（DDA）：按預設規(guī)則選擇zuì強離子進行MS/MS碎片分析，常用于初步鑒定；

（2）數(shù)據(jù)獨立采集（DIA）：對所有離子并行碎片化，提高了數(shù)據(jù)完整性和定量一致性，特別適合大規(guī)模無biāojìdìng量項目。

在百泰派克生物科技，我們靈活結合DDA和DIA策略，依據(jù)項目需求定制zuì佳實驗設計，確保獲得全面且jīngzhǔn的dànbáizhì定量數(shù)據(jù)。

三、基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學標準流程

1、樣本制備與dànbáizhì消化

優(yōu)化蛋白提取、定量和酶切（如FASP、SP3方法）是保障數(shù)據(jù)質量的dìyī步。百泰派克采用高效、低偏倚的樣本處理流程，兼顧不同樣本類型（如組織、血漿、細胞系）。

2、LC-MS分析

通過納升流LC系統(tǒng)（nanoLC）耦合高分辨率質譜，采用優(yōu)化的梯度洗脫方案，提高肽段覆蓋率和定量精度。

3、數(shù)據(jù)處理與定量分析

利用優(yōu)良的分析軟件（如MaxQuant、DIA-NN、Spectronaut）進行原始數(shù)據(jù)處理，結合歸一化算法（如LFQ Intensity、iBAQ、MSstats）實現(xiàn)jīngzhǔn定量。

4、生物信息學挖掘

進一步進行統(tǒng)計分析（如差異表達分析）、富集分析（GO、KEGG）及網(wǎng)絡分析（PPI），挖掘潛在的生物學意義。

四、基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學的優(yōu)勢與挑戰(zhàn)

1、優(yōu)勢

（1）無標記、成本可控：無需昂貴的標記試劑，降低整體實驗費用；

（2）樣本適應性強：適合組織、體液、細胞等多種類型；

（3）靈活擴展：便于增加樣本批次，無需預先計劃標簽數(shù)；

（4）高通量與高重復性：特別是在高分辨質譜支持下，能實現(xiàn)成百上千蛋白的jīngquè定量。

2、挑戰(zhàn)

（1）技術依賴性高：對樣本制備、儀器穩(wěn)定性及數(shù)據(jù)處理要求嚴格；

（2）數(shù)據(jù)量龐大，解析復雜：需要高效的計算平臺與zhuānyè的數(shù)據(jù)分析能力。

百泰派克生物科技依托優(yōu)良的儀器平臺與經(jīng)驗豐富的科研團隊，從樣本準備到數(shù)據(jù)解析提供一站式服務，助力客戶高效完成無biāojìdìng量dànbáizhì組學研究。

五、應用場景示例

• 疾病生物標志物篩選：通過不同組學樣本間dànbáizhì表達量差異，發(fā)現(xiàn)潛在生物標志物；

• 機制研究：揭示信號通路變化，探索疾病發(fā)生發(fā)展的分子機制；

• 藥物作用機制解析：監(jiān)測藥物處理前后dànbáizhì表達譜變化，評估療效或副作用；

• 生物過程動態(tài)監(jiān)測：如干細胞分化、免疫應答等動態(tài)事件中的dànbáizhì組變化。

百泰派克生物科技的無biāojìdìng量解決方案

百泰派克生物科技基于國際lǐngxiān的Orbitrap Exploris 480和timsTOF Pro平臺，結合自主優(yōu)化的LFQ工作流程，已成功為多家高校、醫(yī)院及生物醫(yī)藥企業(yè)提供高質量的無biāojìdìng量dànbáizhì組學服務。我們的優(yōu)勢包括：

• 樣本適配廣泛（組織、血清、外泌體等）

• 高覆蓋率（單次分析可鑒定>6000蛋白）

• 高定量準確性（CV≤20%）

• 個性化數(shù)據(jù)分析報告，支持SCI論文發(fā)表

基于LC-MS的無biāojìdìng量dànbáizhì組學正在以其dútè的優(yōu)勢推動生命科學研究不斷向前。隨著儀器性能與數(shù)據(jù)分析方法的持續(xù)進步，其應用領域將更加廣闊。百泰派克生物科技致力于以zhuānyè的技術力量和優(yōu)質的服務體驗，助力您的科研探索與創(chuàng)新突破。如果您正在尋找高效、可靠的無biāojìdìng量dànbáizhì組學合作伙伴，歡迎聯(lián)系我們，了解更多定制化服務方案！

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

基于LC-MS的無標記定量蛋白質組學：高效鑒定與定量分析檢測技術服務詳情介紹