熒光顯微鏡是光學顯微鏡的一種，原理是用特定波長的激發光照射樣品，使之發出熒光，從而讓觀察者對樣品的內部結構進行觀察。光學顯微鏡則是利用透鏡組合將物體放大幾百至1000倍進行觀察。一般如果被觀察物是透明的，或者內部結構不能很好地從顏色上進行很好的區分，那么熒光顯微鏡是一個不錯的選擇，能夠解決普通顯微鏡無法觀察透明物質的問題。是生物學、細胞學、腫瘤學、遺傳學、免疫學等研究工作的理想儀器，可供科研院所、醫療、防疫和農牧等部門使用。
聚光鏡是熒光顯微鏡很重要的一個組成部分，用石英玻璃或其他透紫外光的玻璃制成。分明視野聚光器的暗視野聚光器兩種，還有相差熒光聚光器。
1.明視野聚光器，具有聚光力強，使用方便，特別適于低、中倍放大的標本觀察。
2.暗視野聚光器，應用日益廣泛，因為激發光不直接進入物鏡，因而除散射光外，激發光也不進入目鏡，可以使用薄的激發濾板，增強激發光的強度，壓制濾板也可以很薄，因紫外光激發時，可用無色濾板(不透過紫外)而仍然產生黑暗的背景。從而增強了熒光圖像的亮度和反襯度，提高了圖像的質量，觀察舒適，可能發現亮視野難以分辨的細微熒光顆粒。
3.相差熒光聚光器，與相差物鏡配合使用，可同時進行相差和熒光聯合觀察，既能看到熒光圖像，又能看到相差圖像，有助于熒光的定位準確。一般熒光觀察很少需要這種聚光器。
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