食品中的微生物是造成食品變質的主要因素。人們在生活不斷總結出的各種食物保藏方法也是為了避免在食品中滋生微生物加速食品變質。但是我們的生活中微生物無處不在，有有益的有有害的，針對食品中的各種微生物檢測我們應該做什么呢？
食品中的微生物按照其對人類有無危害可分為兩類：一類是有益菌，例如酵母菌、乳酸菌等，可用來釀造美酒或腌制咸菜。另一類是有害菌：例如大腸菌群及其他腸道性致病菌，它們會引起食物中毒或引發傳染病。食品中的細菌總數、大腸菌群是肯定要做檢測的，而且有限值，致病菌要求不得檢出，霉菌酵母菌部分食品有限制，北京智云達食安專家提醒。參考食品微生物檢測的標準詳細了解檢測指標。
食品衛生質量的細菌污染指標是菌落總數和大腸菌群。食品中的細菌數量一般是以單位（g、ml）食品中細菌的個數來計，常用菌落總數來表示。利用菌落總數一方面可以起到監督食品的清潔狀態的作用，另一方面可以用來預測食品的保藏期。大腸菌群是腸道致病菌污染的指示菌，它一般直接或間接來自人與溫血動物糞便。食品中如檢出大腸菌群，就表示食品曾受到污染。
菌落總數和大腸菌群是食品的衛生指標，絕大部分食品都需要檢驗這兩個指標是否合格。其中，菌落總數培養時間是48小時，大腸菌群的檢測時間也在24到72小時之間。按照國標要求，菌落總數和大腸菌群是食品企業出廠時必須檢驗的項目。
除衛生指標之外，食品中還需檢驗是否含有致病菌（致病菌不得檢出），包括霉菌和酵母菌以及沙門氏菌、志賀氏菌、金黃色葡萄球菌等。致病菌的種類很多，并非所有食品所檢致病菌都相同，常檢的致病菌有沙門、志賀氏菌、金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌等。
食品在檢測過程中不能一概而論，根據產品的類別不同，檢測項目也存在差別，一般可以按照產品和原材料等所屬的衛生標準來確定檢測的項目。由于食品被微生物污染引發的食物中毒等現象時有發生，尤其是夏季更適合微生物生長繁殖，尤其是食堂、學校等人群密集的地方，及時做好食品中的微生物檢測工作很必要，北京智云達推出多款不同微生物檢測紙片，還有食品微生物檢測箱、食品安全檢測箱等均適用。
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