離子色譜和液相色譜是分析儀器中重要的兩種類型，都對支持于實際的科學檢測中。但是，如何區分離子色譜和液相色譜呢？下面主要就氣路、流路、流動相、試劑要求、色譜柱、抑制器、檢測器和檢測對象這幾部分對這兩者進行區分。 離子色譜 液相色譜 氣路（氮氣或氦氣） 對用NaOH流動相，用于保護流動相以免同空氣接觸。其它系統可以不用氣路，用量少。 一般無，但ELSD和MS需要，用量大。 流路系統 全peek材料，耐強酸強堿和一般反相有機試劑 特殊金屬材料為主，耐有機溶劑，不耐強酸強堿 流動相 以強酸強堿為主，兼反相系統，不能用于正相。流動相種類少 正反相系統兼離子交換。種類相對較多。 試劑要求 對去離子水要求*，大于17.8mΩ,成本很高。有機試劑也要考慮離子雜質，至少HPLC級。 水要求相對較低，大于10 mΩ，成本不高。要求HPLC級試劑。 色譜柱 通用性較差，樣品對柱子有很強的選擇性，品牌少選擇余地小，價格高。 通用性強，品牌多選擇余地大，價格相對較低。 抑制器 有二種：單柱法（無） 和雙柱法，靈敏度高 用電導時，測定陰離子可以需要。 檢測器 以電導為主，可以用PAD、UV、FU、MS等 以紫外為主，其它的有FU、DAD、RI、PAD、ELSD、MS、ED等 分析對象 早期以陰離子為主，現可以分析無機、有機陰陽離子，也可分析極性的有機物，糖及生物大分子等。分子對象范圍較小，以離子化合物為主。 可以分析部分無機物，但靈敏度低。以有機物為主，選擇不同的柱子可以分子各種大小分子。分析對象范圍大。
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