目前顆粒清潔度檢測主要存在3方面問題：
一、濾膜選擇與前處理顆粒積聚、濾膜發黑的問題
1.目前作為顆粒度檢測的濾膜材質有很多，如纖維素膜、特氟龍膜、尼龍濾膜、網格濾膜等。其中纖維素膜和網格濾膜比較常用。
2.很多客戶反映在使用纖維素濾膜會出現濾膜發黑的問題，導致顆粒無法辨認。此問題是因為工件中的油脂在加工過程中在熱作用下生產碳黑、焦油、樹脂而不溶于萃取液，過濾時滯留在纖維素濾膜上，所以使濾膜變黑變黃。在工件的油脂較多的情況下，應使用網格濾膜
選擇了網格濾膜的情況下，有時會姓網格反光，需要注意選擇有光濾片的清潔度儀，以避免把網格的反光誤判成金屬顆粒，降低樣品合格率。
3.另外在制作濾膜時，會發生顆粒積聚、分散不均勻的問題。這是因為在操作時，噴壺噴嘴直接對濾膜沖刷造成。正確的方法應該是使濾液沿著管壁緩緩流過濾膜
二、測試耗時過長與測量精度易受人為操作影響
1.傳統顯微鏡式顆粒清潔度儀是通過在濾膜上畫格，逐格局部放大顆粒，然后用軟件將局部圖拼接成大圖。據某發動機公司反映，顯微鏡式測試每次需花費20分鐘至40分鐘(不計前處理)，難以應付普通的測試量(一天10個樣品)，經常要加班。而且其配置的軟件不可根據客戶的測試標準不同進行不同的尺寸分級。
2.顯微鏡式顆粒清潔度儀的微距需定期上門或發回供應商處校準(多數為一年校準一次)，否則，當微距出現小至微米級的偏差時，就會將每格邊緣的顆粒或較大顆粒裂解成多個顆粒，造成結果不準確
3.同時，人為調焦也是影響結果準確性的一個主要因素。某發動機公司的反饋結果是，當焦距調遠時，可見顆粒數量會減少，當焦距調近時，顆粒數量會增加，因此，其結果的客觀性值得懷疑。
解決方案是使用掃描式顆粒清潔度儀，通過高精度掃描儀一次掃描成像，2.5分鐘即可完成掃描，0.5-1分鐘后就得出測試結果與報告。整個測試時間在3分鐘左右。全過程為儀器自動操作，*避開人為操作的影響。
三、運輸包裝問題。
很多客戶反映：零件在出貨時的顆粒度檢測是合格的，但是包裝好發貨到下游時，在下游客戶處再作顆粒度檢測卻是不合格的。造成這個問題的原因是零件在打包出貨時零件之間的孔隙比較稀松，隨后運輸過程中的顛簸會使零件之間相互磕碰，造成新的顆粒產生。由此以來，再加上包裝掉落的碎屑，零件到客戶處的時候，顆粒清潔度肯定容易超出要求范圍。因此，小零件在發貨前建議采用真空打包，避免零件磕碰的現象發生。
目前，利用掃描法原理的顆粒物清潔度儀已是清潔度測試的主流趨勢，克服了顯微鏡式顆粒清潔度儀測量單個樣品耗時長、數據易受校準情況和人為因素的影響，報告無法根據客戶要求分級等弊端。
