二氧化碳培養箱廣泛應用于微生物、醫學、制藥、環保、食品、畜牧等科學領域的研究和生產。常見于細胞動力學研究、哺乳動物細胞分泌物的收集、各種物理、化學因素的致癌或毒理效應、抗原的研究和生產、培養雜交瘤細胞生產抗體、體外授精(IVF)、干細胞、組織工程、藥物篩選等研究領域。
二氧化碳培養箱應由專人負責使用，操作盤上的任何開關和調節旋扭一旦固定后，不要隨意扭動，以免影響箱內溫度，二氧化碳濃度，濕度的波動，同時降低機器的靈敏度。
箱子的放置要水平，避免陽光直射和灰塵等，要儀器周圍的氣流循環，后部及側面應留出5 cm的空隙。加裝穩壓電源電源電壓波動不超過220 V±10%。所加入的水必須是蒸餾水或無離子水，防止礦物質儲積在水箱內產生腐蝕作用，經常檢查箱內水是否足夠，水位應加至“水位指示燈”滅燈時為止。
使用前箱內應用消毒酒精或碘溶液*擦洗，防止其他微生物污染，導致實驗失敗。在房間安裝空調，使環境溫度保持在25~C左右。
所使用的二氧化碳必須是純凈的，否則降低二氧化碳傳感器的靈敏度和污染二氧化碳過濾裝置。
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