高錳酸鹽指數是一個相對的條件性指標，其測定結果與水樣的各種因素有關。 所以，我們要保證高錳酸鹽指數測定的準確性，必須做好全程序的質量控制。
1. 水樣保存和均化
水樣應使用磨口塞的硼硅玻璃容器，且在盛裝水樣前應用水樣淋洗，使瓶壁所吸附的成分與水樣一致。采集的水樣須立即分析，這是由于水樣中存在微生物，它會使有機物分解，引起高錳酸鉀指數的變化。若不能立即分析，可向水樣中加入硫酸至水樣pH<2，并置于0-5℃環境中，保存期為2天。
均化：分析樣品時應充分搖動、混合均勻。
2. 酸度
反應體系的酸度對整個反應的速度和方向有較大的影響，因此酸度必須適宜，否則將會導致測定結果出現偏差。
當酸度較低時，高錳酸鉀的氧化性降低，高錳酸鉀易被氧化為二氧化錳沉淀，從而影響其對水體中無機和有機還原性物質的氧化，使測定結果偏低；
當酸度過高，則會促使生成草酸，反應中H+的消耗會干擾反應的正常進行，使高錳酸鉀在有限的時間內不能充分發揮其氧化作用，使測定結果偏低。
3.高錳酸鉀標準溶液
按照標準上的配制方法配制出高錳酸鉀標準溶液，在空白試驗或者高錳酸鹽指數很低的水樣分析時，當進行到國標7.2步，用滴定管加入10.00 ml草酸鈉標準溶液(4.6)至溶液變為無色，但有時會出現顏色仍為淡粉紅色的情況，為什么會出現這種情況?
高錳酸鉀溶液濃度的最佳值應略小于0.0100 mol/L( K值應介于0.950～1.01之間)。
4.空白試驗、實驗用水
空白樣品的測定值應小于方法檢出限( 空白值0.4～0.5 mg/L)。實驗用水對于測定結果有明顯影響，空白值的高低對于測定結果的準確性至關重要。
在測定高錳酸鹽指數時，對制備好的試驗用水應及時使用，密閉保存，且保存期限不要超過5 d，最好取用新鮮蒸餾水，保證空白值滴定體積在0.35~0.60 ml之間，以減少空白值對測定結果的影響。
大量試驗研究證明，普通蒸餾水、用堿性高錳酸鉀法新燒制的二次蒸餾水，以及電導率<2.0 µs/cm(25℃)的去離子水均可以用作實驗用水。
5.加熱方式和溫度
水浴加熱具有溫度低、加熱均勻但時間較長的特點，屬于國家標準規定的加熱方式。在實際操作中，有的分析工作者嘗試使用電熱板直火加熱處理樣品，可以節約時間和能源。但電熱板直火加熱存在溫度高、加熱不均勻的缺點。
由于高錳酸鹽指數是一個條件性指標，加熱方式為沸水浴，溫度為96℃～98℃。如在高原地區，報出數據時，需注明水的沸點。
沸水浴的水面要高于錐形瓶內的液面( 1 cm以上) 。
6. 加熱時間
加熱時間對于試樣中的氧化過程至關重要，如果時間短，氧化率過低使測定結果偏低，而時間增長，氧化率過高又會使測定結果偏高，因此在高錳酸鹽指數的實際測定過程中，樣品加熱時間應嚴格按照國標中規定的水浴沸騰加熱時間30min±2min操作。
7. 加熱時間
滴定過程需要控制的是試樣的溫度、滴定速度和時間以及終點觀察。
⑴ 滴定過程的試樣溫度
酸性條件下高錳酸鉀與草酸鈉的反應溫度應保持在60℃～80℃之間。
⑵ 滴定速度和時間
整個滴定過程應采取慢-快-慢的滴定速度，應在2min內完成滴定。
⑶ 終點觀察
在滴定時在錐形瓶置于白紙上或置于自制的帶有凹槽的泡沫板中，更容易觀察到滴定結果。
滴定終點應為淡粉紅色，并保持30s不褪色。
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