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移液器屬于精密儀器，如未得到適當的維護，其性能會受到嚴重影響。移液器潔凈度對眾多實驗室應用至關重要，為了維持其潔凈度，必須對移液器進行充分的清潔和去污。
———— 移液器的日常清潔 ————
使用無污染的移液器能確保準確性，因此每次使用前后必須確保移液器清潔。
日常只需清潔移液器的外表面即可，操作如下:
1. 拆除移液器中的安全圓錐過濾器
2. 使用柔軟的無紡布蘸取消毒液或中性清潔劑輕輕擦拭移液器的表面
3. 用蘸取純水（3級）或蒸餾水的濕布*清除移液器上的所有清潔劑然后擦干
4. 將新的安全圓錐過濾器安裝在移液器上
———— 清潔和去污 ————
清潔是指去除移液器上的一切異物，如灰塵、核酸、蛋白質、緩沖液和鹽。
去污是指去除或殺死病毒、細菌和真菌等微生物。此外還涉及化學品和放射性物質的去除或中和。
移液器的下半部分要根據使用情況及時清潔和去污，建議每3個月清潔一次, 操作如下:
1. 參閱移液器用戶手冊，查看移液器清潔或去污方案及所選清潔溶劑的化學兼容性
2. 戴上手套，拆下移液器下半部分部件
3. 使用所選的清潔劑*清潔移液器的下半部分部件，并擦拭移液器手柄的外部
4. 使用純水（3 級）或蒸餾水*清除移液器上殘留的清潔溶劑
5. 重新潤滑移液器
6. 移液器的維護和性能測試可外包給服務供應商
為了*清潔和去污，還可對移液器進行高壓滅菌，操作如下：
1. 取下安全圓錐過濾器
2. 確認可高壓滅菌的部件
3. 將移液器或部件放入滅菌袋，然后置于高壓滅菌鍋內
4. 在121℃和1 bar的高壓下滅菌20分鐘
5. 冷卻并晾干相關部件
6. 安裝新的圓錐過濾器
7. 重新組裝移液器并進行性能檢查
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