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上新|全流程自動化!睿科蛋白組學樣本前處理解決方案

閱讀:601      發布時間:2024-1-23
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隨著生物質譜技術迅速發展,質譜技術已經逐漸成為了蛋白質組學分析的主流技術。質譜儀器具有高靈敏度、高分辨率等特點,樣本前處理的質量和可重復性顯著影響質譜儀的分離和鑒定能力。



蛋白質組學樣本前處理流程復雜、處理時間長(傳統蛋白質組前處理需過夜),人工操作易失誤,造成了樣品前處理不穩定、重現性差等問題,急需一種操作簡便、高效、安全性能強、抗干擾能力強的自動化解決方案,保證結果的準確性和可靠性。




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睿科蛋白組學樣本前處理解決方案





睿科推出全新蛋白組學樣本前處理工作站,配套睿科蛋白組學樣本前處理試劑盒,為蛋白組學樣本前處理提供全自動解決方案,高效地實現質譜蛋白樣本前處理自動化和標準化操作。


蛋白組學樣本前處理解決方案適用于血漿、血清、尿液、細胞、組織等類型樣本從蛋白到多肽混合物的質譜檢測前處理工作,試劑盒利用新型固相烷基化試劑SPA材料與蛋白的特異性共價反應,實現蛋白質的高效捕獲,通過清洗磁珠表面,快速去除干擾物質,并進行原位固相酶解,獲得蛋白酶解產物,儀器整合制冷模塊、磁吸附模塊、加熱振蕩模塊、抓扳手,進而實現蛋白質組提取、還原、烷基化、酶解等流程自動化操作,提高蛋白質樣品的處理效率和回收率。






蛋白組學樣本前處理工作站

蛋白組學樣本前處理工作站右側s.png

一款具備高通量、高回收率、安全性能強、抗干擾能力強,適用范圍廣等優勢,適用大隊列樣本的高通量處理設備,可實現質譜蛋白樣本前處理的全自動化和標準化操作。


蛋白組學樣本前處理試劑盒

(新型固相烷基化試劑)

圖片.png

產品適用于處理各種來源的蛋白質組樣品,如細胞、血漿、細菌、腫瘤組織等,采用新型固相烷基化試劑,蛋白質可與其它小分子(如糖、鹽、表面活性劑、脂類等)實現快速分離,提高蛋白質的純度,顯著降低樣本復雜程度。同時,試劑表面親水性較好,可顯著提高蛋白質或酶解產物的回收率。




方案優勢





96通量圖-高通量(1).png

96通道移液模塊

?高通量

96通道移液頭,一次可處理最多96個樣本,高效完成實驗流程中吸廢等步驟;

兼具8通道移液功能,可以實現試劑的精準分裝;

全流程4-5小時可完成96個蛋白樣本的前處理(具體時間根據具體實驗流程);


?自動化程度高

整合抓板手,用于對標準SBS板子的轉移;

整合蛋白前處理所需的試劑制冷模塊、磁吸附模塊、加熱振蕩模塊等功能模塊;

均一化操作,減少實驗過程中的誤差,提高準確性和穩定性;


盤面設計.png

儀器盤面設計

?靈活性強

盤面包含18個SBS標準盤位,除功能模塊外,有15個盤位放置試劑和耗材;

開放式平臺,配有多樣化適配器,可適配多種不同品牌試劑耗材;

軟件界面人性化設計,拖拽式布局,操作簡單,每個步驟可獨立進行參數設置,實驗流程可進行存儲,按鍵式啟動運行;


儀器軟件設計.png

儀器軟件設計


?安全性

可配置避光外罩,搭配紫外消毒燈;

可根據實驗需求選配正、負壓HEPA過濾系統,有效避免交叉污染;





測試數據




Part 1:批內測試數據

材料:293T 細胞

實驗方法:手工操作3 組,儀器操作3 組

Q Exactive質譜結果如下:




表1:手工操作和儀器操作后蛋白數及零漏切率對比

蛋白表1.png

圖1 Venn diagram(藍色:手工;綠色:儀器)


試驗總結


·手工操作和儀器操作蛋白樣本預處理后可檢測到的蛋白數及零漏切率基本一致,達到預期要求;

·手工操作與儀器操作蛋白種類皮爾斯相關系數大于0.97,與預期一致;




Part 2樣本批間測試數據


圖2 96孔板檢測示意圖



如圖2所示共處理96個樣品,分三組進行實驗,隨機選取36個樣品進行Q Exactive質譜檢測,結果如下:



圖3.png

圖3 36個樣本檢測蛋白數(個)






圖4.png

圖4 36個樣本零漏切率(%)




圖5.png

圖5 隨機樣品日間比較


實驗總結


·36個隨機樣本檢測蛋白數3074±89個,零漏切率78.32±2.66%,樣本預處理的結果正常且穩定;

·36個樣品的皮爾斯相關系數及日間隨機樣品皮爾斯相關系數均介于0.955-0.989之間,達到指標要求,具有較好的均一性。





應用領域



臨床診斷、用藥指導、病理機制研究、疾病標志物的發現、藥物機理研究








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