超聲波作為細胞分解的良好控制手段，為此，超聲波的機械效應提供更快，更完整的滲透溶劑的細胞材料和改善轉移質量。超聲波可以更好地滲透到植物組織中并改善質量傳遞。超聲波產生空化破壞細胞壁并促進基質成分的釋放。
超聲波通常用于改善從植物種子中提取的脂類和蛋白質，如大豆（如面粉或脫脂大豆）或其他油料種子。在這種情況下，細胞壁的破壞促進了壓榨（冷或熱），從而減少了壓餅中的殘余油脂。超聲波幾乎能支持任何商業生產能力，對大豆蛋白質進行親水化，當使用較厚的漿液時，所需的超聲處理能量低。
超聲波萃取設備是利用超聲波輻射壓強產生的強烈空化應效應、機械振動、擾動效應、高的加速度、乳化、擴散、擊碎和攪拌作用等多級效應，增大物質分子運動頻率和速度，增加溶劑穿透力，從而加速目標成分進入溶劑，促進提取進行的成熟萃取技術。
當以高強度超聲處理液體時，傳播到液體介質中的聲波會產生交替的高壓(壓縮)和低壓(稀疏)循環，其速率取決于頻率。在低壓循環期間，高強度的超聲波會在液體中產生小的真空氣泡或空隙。當氣泡達到不能再吸收能量的體積時，它們在高壓循環中劇烈地坍塌，這種現象稱為空化。在爆炸期間，局部將達到非常高的溫度（約5，000K）和壓力（約2，000atm）。空化氣泡的崩潰也導致液體射流高達280m/s的速度，所產生的剪切力機械地破壞細胞膜并改善材料轉移。根據所采用的超聲波參數，超聲波對細胞有破壞性或建設性影響，取決于所使用的超聲參數。
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