通過在線監測氨氮的濃度值來選擇過渡區的運行狀態(曝氣還是攪拌)。比如北方地區冬季溫度較低，硝化過程受抑制，即使在增加硝化區容積條件下，仍不能有效降低出水氨氮的濃度，而曝氣池中的溶解氧濃度已經超過上限閾值(如2mg/L)。在這種情況下，控制系統應以溶解氧濃度為被控制參數對供氧強度實施限定性調節，將溶解氧濃度控制在2mg/L左右，當氨氮濃度過低時，轉換到以氨氮濃度作為目標參數控制供氧強度。
如果溶解氧濃度已經維持在較高值，但氨氮濃度仍不能達到出水要求，需增加硝化區的 容積，即將好氧過渡區作為硝化用；如果氨氮濃度已經很低，則好氧過渡區應作為反硝化用，以盡可能多地進行反硝化。這種控制措施可以根據不同的進水負荷和條件，自動地改變硝化區和反硝化區的容積比例，以大限度地滿足硝化和反硝化的要求。通過氨氮分析儀控制好氧過渡區的運行狀態見圖6-54。
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