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離子色譜和液相色譜是分析儀器中重要的兩種類型，都對支持于實際的科學檢測中。但是，如何區分離子色譜和液相色譜呢？下面小編主要就氣路、流路、流動相、試劑要求、色譜柱、抑制器、檢測器和檢測對象這幾部分對這兩者進行區分。
離子色譜：
氣路（氮氣或氦氣）：對用NaOH流動相，用于保護流動相以免同空氣接觸。其它系統可以不用氣路，用量少。
流路系統：全peek材料，耐強酸強堿和一般反相有機試劑
流動相：以強酸強堿為主，兼反相系統，不能用于正相。流動相種類少
試劑要求：對去離子水要求*，大于17.8mΩ,成本很高。有機試劑也要考慮離子雜質，至少HPLC級。
色譜柱：通用性較差，樣品對柱子有很強的選擇性，品牌少選擇余地小，價格高。
抑制器：有二種單柱法（無）和雙柱法，靈敏度高
檢測器：以電導為主，可以用PAD、UV、FU、MS等
分析對象：早期以陰離子為主，現可以分析無機、有機陰陽離子，也可分析極性的有機物，糖及生物大分子等。分子對象范圍較小，以離子化合物為主。
液相色譜：
氣路（氮氣或氦氣）：一般無，但ELSD和MS需要，用量大。
流路系統：特殊金屬材料為主，耐有機溶劑，不耐強酸強堿。
流動相：正反相系統兼離子交換。種類相對較多。
試劑要求：水要求相對較低，大于10 mΩ，成本不高。要求HPLC級試劑。
色譜柱：通用性強，品牌多選擇余地大，價格相對較低。
抑制器：用電導時，測定陰離子可以需要。
檢測器：以紫外為主，其它的有FU、DAD、RI、PAD、ELSD、MS、ED等
分析對象：可以分析部分無機物，但靈敏度低。以有機物為主，選擇不同的柱子可以分子各種大小分子。分析對象范圍大。
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