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液相色譜儀是屬于易學難用的儀器，特別講究 “正確使用” 和經驗。液相工作者接觸最多的是流動相，流動相是造成液相色譜各種問題的主要源頭。液相色譜儀最常見的故障一是堵，二是漏。
“堵”的原因之一：配制流動相時細菌污染。
堵塞的主要位置就是在液相色譜儀色譜柱的前端，最主要原因就是流動相里有雜質，雜質的主要來源就是細菌。
首先我們要認識到，一般的國產甲醇其實不需要額外過濾處理，直接使用沒有問題。即使是有些固態微粒雜質，也能在液相流路系統最前端的過濾頭上排除，真正容易引起問題的，是水中的細菌。新制備的純水在室內放置幾天就會長菌，而這些細菌雖然肉眼不可見，卻足以堵塞柱填料顆粒的空隙，造成柱子很快報廢。時間過久,濾頭黏附細菌導致泵液不準
解決液相色譜儀“堵”的方法很簡單，就是確保水的可靠性。這里有兩種方式推薦：
（1）購買實驗室專用純水機，既方便又可靠，質量也放心。缺點就是價格不菲。
（2） 成箱購買市售品牌純凈水，如500ml 一支的怡寶或娃哈哈，這些水的質量足以應付液相色譜的要求。
這里特別指出一個細節：在絕大多數書本上，凡談到配制流動相都會談到最后有一個過濾的步驟。
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