一是采用被動控濕法，即通常的二氧化碳培養箱內均放置一個3L的水盤，內盛3L無菌純水，依靠水的自然蒸發，使箱體內濕度達到95%。
二是一些二氧化碳培養箱，采用主動加濕系統（蒸汽發生器，加熱水盤，噴霧器等），可以控制箱體內的濕度。 然而在這種高濕度條件下，放置在箱體內部的水盤中的純凈水，很容易造成微生物的滋生，產生污染，導致細胞培養*失敗。
目前，控制水盤內污染的方法有如下幾種：
1、定期（至少每兩周一次），更換水盤內的無菌蒸餾水或無菌去離子水。
2、在水盤內添加適量硫酸銅，配制方法：20g無水硫酸銅＋5ml濃硫酸＋1L滅菌純水。
3、夏季氣溫高時，水盤里加0.02％的疊氮鈉可以有效的預防真菌污染。
4、水盤內添加適量抗生素。
5、定期為培養箱（含水盤）進行一次高溫滅菌。
6、使用專用的水盤污染控制試劑，如市面上有些二氧化碳培養箱廠家提供水盤污染控制專用的銀離子消毒盒，說明書上描述能有效殺滅600中微生物，能持續使用6個月，但此類專用污染控制試劑較常規方法，存在價格較昂貴缺點
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