西藥制作領域追求高純度、高質量的藥物成分一直以來都是制藥企業和科研人員的不懈目標，但如何能夠在原料提取有效成分時迎來更大的突破，傳統的精餾技術總是存在一定的局限性。
20世紀初，德國科學家基于分子運動理論，開發出了分子蒸餾技術，用于解決傳統蒸餾方法難以分離的高沸點、熱敏性物質的分離問題，隨著分子蒸餾技術的不斷成熟和高效的分離效果，近年來分子蒸餾技術在中藥有效成分提取、西藥成品績及中間體分離純化中的應用更加廣泛。
例如二十八烷醇具有增進體力、增強耐力、精力，提高反應靈敏性和應激能力，提高機體代謝率，改善心肌功能，降低血清膽固醇和甘油三酯含量，降低收縮期血壓等功能，越來越被人們所重視。許松林等人利用短程蒸餾技術從蜂蠟中提取二十八烷醇，使用分子蒸餾實驗條件設置為進料速率 75 mL/h，進料溫度160 ℃，蒸餾溫度 200~260 ℃，蒸餾壓力 0:1 Pa，刮膜器轉速 80 r/min，冷冷凝水溫度 25 ℃，經過十級分離，二十八烷醇含量從原料中的 10.0%提高到最終產品 60.0%，收率也可達到11%，遠遠高于其他分離純化方法。
在抗生素生產中，如青霉素的精制，發酵得到的粗品含有蛋白質、色素等雜質，分子蒸餾能在溫和條件下，根據雜質與青霉素分子運動平均自由程的差別，高效去除雜質，提升青霉素的純度與穩定性，降低藥物使用時的不良反應發生率。
如今，分子蒸餾已經在西藥制作的提取和提純環節中占據著極為重要的地位，有力推動了西藥朝著更高純度、更高質量的方向不斷發展進步，為現代制藥工業注入了強大動力，也為攻克更多疑難病癥提供了更優質的藥物保障。
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