冷凍干燥機在低溫下干燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小。凍干過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的形狀。由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。由于物料中水分在預凍以后以冰晶的形態存在，原來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中。升華時，溶于水中的溶解物質就析出，避免了一般干燥方法中因物料內部水分向表面遷移所攜帶的無機鹽在表面析出而造成表面硬化的現象。干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速，幾乎立即恢復原來的形狀。由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。干燥能排除95%-99%以上的水分，使干燥后產品能長期保存而不致變質。
冷凍干燥機進行冷凍干燥的基本過程如下：
1.制品的制備（前處理）：如藥物的培養、滅菌、洗瓶、分裝、半加塞等，食品原料的挑選、清洗、滅酶、切分、分裝等。
2.制品的凍結（預凍）：將制品凍結成固態形式。
3.第①階段干燥（升華干燥）：將制品中的冰晶以升華方式去除。
4.第二階段干燥（解吸干燥）：將殘留在制品中的水分在較高溫度下蒸發一部分，使殘余水分達到預定的要求。
5.密封包裝：已干制品一般應在真空或充惰性氣體條件下進行密封包裝，以方便儲存。
冷凍干燥機是把含有大量水分物質，預*行降溫凍住成固體，然后在真空的條件下使水蒸汽直接蒸發出來，而物質自身剩留在凍住時的冰架中，因此它干燥后體積不變，疏松多孔在提高時要吸收熱量。凍干機_冷凍干燥機干燥后，體積和形狀不變，復水性好，更好的保存物品，延長保存期。但是，凍干機_冷凍干燥機在使用前一定要做好滅菌，不要把細菌帶到食物或其他干燥物品中，否則會導致很嚴重的后果。
冷凍干燥機設備滅菌流程：
1.干燥：將凍干腔室(前室)和冷凝室(后室)經過加熱、抽真空進行干燥。
2.抽真空：將凍干腔室(前室)和冷凝室(后室)進行抽真空，以利于過氧化氫氣體注入，保證滅菌階段時過氧化氫氣體的均勻分布。
3.滅菌：向腔室內注入過氧化氫氣體，達到特定值并堅持一段時間(注：根據需要，在滅菌階段可多次抽真空和注入過氧化氫氣體)。
4.排殘：滅菌完成后，經過多次抽真空和放空，降低汽化過氧化氫濃度，直到殘留達到安全指標。
冷凍干燥機將被干燥的物品先凍結到三相點溫度以下，然后在真空條件下使物品中的固態水份（冰）直接升華成水蒸氣，從物品中排除，使物品干燥。物料經前處理后，被送入速東倉凍結，再送入干燥倉升華脫水，之后在后處理車間包裝。真空系統為升華干燥倉建立低氣壓條件，加熱系統向物料提供升華潛熱，冷系統向冷阱和干燥室提供所需的冷量。冷凍干燥機采用高效福射加熱，物料受熱均勻；采用高效捕水冷阱，并可實現快速化霜；采用高效真空機組，并可實現油水分離；采用并聯集中冷系統，多路按需供冷，工況穩定，有利節能；采用人工智能控制，控制精度高，操作方便。
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