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　　蛋白純化儀可用于分離膜蛋白、酶、動物、植物和細菌的受體，還可以替代一些分離方法如硫酸銨分級法作為純化蛋白的*步，與色譜方法聯用。

　　另外，蛋白純化儀已經可以實現規模化操作。成功地進行了膽固醇氧化酶濁點萃取的中試研究。雖然使用離心分離器可以使CPE大規模連續進行，但商品離心分離器用于CPE 的效率和容量仍需進一步研究。

　　而且，發現相分離操作受細胞培養時產生的表面活性物質影響較大，體系兩相間密度差較小，表面張力較小，含產物的表面活性劑相的流變學行為較復雜，操作較難。

　　蛋白純化儀根據蛋白質帶電性質進行分離蛋白質在不同pH環境中帶電性質和電荷數量不同，可將其分開。

　　1、電泳法

　　各種蛋白質在同一pH條件下，因分子量和電荷數量不同而在電場中的遷移率不同而得以分開。值得重視的是等電聚焦電泳，這是利用一種兩性電解質作為載體，電泳時兩性電解質形成一個由正極到負極逐漸增加的pH梯度，當帶一定電荷的蛋白質在其中泳動時，到達各自等電點的pH位置就停止，此法可用于分析和制備各種蛋白質。

　　2、離子交換層析法

　　離子交換劑有陽離子交換劑和陰離子交換劑，當被分離的蛋白質溶液流經離子交換層析柱時，帶有與離子交換劑相反電荷的蛋白質被吸附在離子交換劑上，隨后用改變pH或離子強度辦法將吸附的蛋白質洗脫下來。