血清沉淀主要是纖維蛋白等蛋白、磷酸鹽、脂類等經凍融后析出，導致血清內出現沉淀現象，該現象與血清品質無關。
大部分品牌的血清都會有這種情況，不會影響細胞培養，只是培養時可能偶爾觀察到血清沉淀，注意區分血清沉淀和細胞污染即可。
血清沉淀較多時可以將血清靜置后，盡量吸走上清，下部有大量沉淀的血清可以2000rpm離心5min后取上清與之前取的上清混合使用。
血清反復凍融、高溫融化、融化不均、滅活等因素均有可能導致沉淀增多，血清融化時應盡量在4℃融化，每隔一段時間搖晃一下。