頂空進樣瓶以玻璃材質為主，一次性使用的進樣瓶成本高、浪費大、對環境污染嚴重，大多實驗室都是將進樣瓶清洗后重復利用。目前，實驗室常用清洗進樣瓶的方法主要都是加入洗衣粉、洗滌劑、有機溶劑及酸堿洗液，然后用定制的小試管刷洗。這種常規的刷洗法缺點很多，洗滌劑和水的使用量大，洗滌用時長，容易留有死角，如果是塑料進樣瓶，易在內部瓶壁留下刷痕，占用大量人力資源。對于脂質和蛋白質殘留污染嚴重的玻璃器皿，采用堿性裂解液進行清洗，會取得良好的效果。
頂空進樣瓶器的操作方法與使用要求：
1、應用頂空時，GC氣體總流量應是頂空的氣流加上GC氣流量，計算分流比時應注意。可以用流量計測量后計算。
2、由于進入頂空的載氣同時進入GC，所以用于頂空的氣體也應凈化。
3、時間設置中，樣品充滿定量管的時間應充分，定量管的平衡時間不應太長，進樣的時間應足夠長。
4、頂空進樣器的壓力調節如果是手動的話，建完方法后應記錄樣品加壓和載氣壓力值，以免由于閥狀態的變化引起壓力變化。
5、頂空瓶加熱溫度，定量管溫度，傳輸線溫度應由小到大，傳輸線小于等于進樣口的溫度。
頂空進樣瓶分析是將樣品放入密閉的小玻璃瓶內，將其氣相部份(稱作頂空)導入氣相色譜的分離柱進行檢測與定量。由此可見，這是一個非常簡單而確定的分析方法。這樣，分析者可以免除樣品的前處理步驟，而集中精力來解釋定量結果和開發新的分析方法，可以有更多的時間來進行研究和開發的評價。
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