液相樣品瓶有三種封口方式：鉗口蓋、卡口蓋及螺口蓋。每種都有各自的優勢與劣勢。
鉗口蓋將隔片擠壓在玻璃樣品瓶的瓶緣與折邊的鋁蓋之間，密封效果非常好，可有效防止樣品揮發。進樣針穿刺取樣時，隔片的位置不變。對鉗口蓋樣品瓶進行封口時需要用壓蓋器。
卡口蓋是鉗口蓋密封方法的一種延伸，套在樣品瓶瓶緣上的塑料蓋通過將隔片擠壓在玻璃與延伸的塑料蓋之間而形成密封。塑料蓋的張力是由于其試圖恢復原來的形狀而產生的。該張力使玻璃、瓶蓋和隔片之間形成密封。塑料卡口蓋無需任何工具就能蓋上，但其密封效果不及其他兩種。
螺口蓋樣品瓶是通用型的。旋緊瓶蓋即施加了一個機械力，將隔片擠壓在玻璃瓶與瓶蓋之間。螺口蓋所形成的密封效果非常好。在進樣針穿刺時隔片由機械力固定在位置上，無需任何工具就可進行封口。
液相樣品瓶材質：
去活化玻璃(DV)
對于具有強極性和可與玻璃的極性玻璃表面結合的分析物，去活化樣品瓶或許是個不錯的選擇。玻璃樣品瓶經過玻璃相反應性有機硅烷處理，產生疏水性玻璃表面。去活化樣品瓶可以無限期地干燥儲存。
聚丙烯塑料
聚丙烯(Polypropylene，PP)是一種非反應性塑料，可用于不適合選擇玻璃的地方。聚丙烯樣品瓶在用火燒時依然可以保持良好的密封性，從而大限度減少暴露于潛在危險物質的可能。可以使用溫度為135 ℃。
液相樣品瓶的選擇很重要，清洗也非常重要。每個實驗室都有大量的樣品需要經由液相色譜、氣相色譜進行檢測，所以會有大量色譜樣品瓶需要清洗。如果采用傳統人工清洗，不僅浪費時間、降低工作效率，而且有時會因無法嚴格控制清洗效果而達不到潔凈要求，導致實驗結果發生偏差，影響后繼實驗進行。
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