案例一：基因表達分析

• 實驗背景：研究團隊欲通過 qRT - PCR 檢測某疾病相關基因在不同組織樣本中的表達差異。

• 檢測結(jié)果：使用 Qubit RNA IQ Assay Kit 對提取的 RNA 樣本進行檢測，發(fā)現(xiàn)部分樣本 RIN 值≥7，濃度在 200 - 500 ng/μL 之間，28S/18S 比值在 1.8 - 2.2 之間；而另一部分樣本 RIN 值在 5 - 7 之間，濃度較低，約為 50 - 100 ng/μL，28S/18S 比值略低于 1.8。

• 實驗設計調(diào)整：對于 RIN 值和濃度都較好的樣本，可直接用于 qRT - PCR 實驗，且可適當減少每個反應的 RNA 上樣量，以避免 RNA 過量導致的非特異性擴增。對于 RIN 值在 5 - 7 之間的樣本，由于其 RNA 有一定程度降解，可能影響定量準確性，研究團隊決定增加每個反應的 RNA 上樣量，并設置多個復孔，以提高檢測的可靠性。同時，在數(shù)據(jù)分析時，對這些樣本的數(shù)據(jù)進行更謹慎的處理和驗證。

案例二：轉(zhuǎn)錄組測序

• 實驗背景：科研人員計劃對某種植物在不同生長階段的轉(zhuǎn)錄組進行測序，以了解其基因表達的動態(tài)變化。

• 檢測結(jié)果：Qubit RNA IQ Assay Kit 檢測顯示，大部分樣本 RIN 值＞8，濃度在 300 - 800 ng/μL 之間，28S/18S 比值接近 2.0，但有少數(shù)樣本 RIN 值為 6 - 7，濃度也相對較低，約為 100 - 200 ng/μL。

• 實驗設計調(diào)整：對于高質(zhì)量的樣本，按照標準的轉(zhuǎn)錄組測序文庫構建流程進行操作。而對于 RIN 值為 6 - 7 的樣本，考慮到轉(zhuǎn)錄組測序?qū)?RNA 完整性要求較高，研究人員首先嘗試優(yōu)化 RNA 提取方法，重新提取這些樣本的 RNA，若再次檢測結(jié)果仍不理想，他們決定將這些樣本用于其他對 RNA 質(zhì)量要求稍低的實驗，如簡單的基因差異表達分析，而不用于轉(zhuǎn)錄組測序，以免因 RNA 質(zhì)量問題影響測序數(shù)據(jù)的質(zhì)量和后續(xù)分析。

案例三：microRNA 研究

• 實驗背景：某實驗室致力于研究 microRNA 在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用，需要從腫瘤組織和正常對照組織中提取 RNA，進行 microRNA 的表達譜分析。

• 檢測結(jié)果：Qubit RNA IQ Assay Kit 的檢測結(jié)果表明，所有樣本的 RIN 值都在 7 - 8 之間，濃度在 150 - 400 ng/μL 之間，但 28S/18S 比值在 1.6 - 1.8 之間，略低于理想范圍。

• 實驗設計調(diào)整：由于 microRNA 相對較小且穩(wěn)定性較高，對總 RNA 的完整性要求不像 mRNA 那樣嚴格。雖然 28S/18S 比值略低，但 RIN 值表明 RNA 整體質(zhì)量尚可。因此，研究人員在實驗設計中，適當增加了 RNA 的起始量，以確保有足夠的 microRNA 用于后續(xù)的分離和檢測步驟。同時，在數(shù)據(jù)分析階段，采用了一些專門針對 microRNA 表達譜分析的算法和質(zhì)量控制措施，以減少可能因 RNA 質(zhì)量問題帶來的誤差。