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初級(jí)會(huì)員 | 第6年

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UbiTest緩沖液:高特異性泛素化檢測的關(guān)鍵

時(shí)間:2025/5/26閱讀:62
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泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)是一種高度調(diào)控的機(jī)制,通過蛋白質(zhì)的泛素化和降解來控制許多細(xì)胞過程。泛素通過其C末端與目標(biāo)蛋白上的賴氨酸殘基結(jié)合,可以以單體形式或聚合鏈形式存在。泛素鏈可以通過泛素的第一個(gè)甲硫氨酸(M1)形成線性鏈,也可以通過其七個(gè)賴氨酸殘基(K6K11K27K29K33K48K63)形成特定賴氨酸鏈。K48K63連接的泛素鏈?zhǔn)羌?xì)胞中最為主要的多泛素化形式。

 

泛素化是一個(gè)可逆的過程,去泛素化酶(DUBs)可以去除目標(biāo)蛋白上的泛素,從而拯救它們免于蛋白酶體降解。確定目標(biāo)蛋白上的多泛素化程度和類型對(duì)于理解它們?cè)谡<?xì)胞過程以及與UPS相關(guān)疾病狀態(tài)中的泛素介導(dǎo)調(diào)控至關(guān)重要。傳統(tǒng)上,這些過程是通過質(zhì)譜分析或使用抗泛素抗體進(jìn)行免疫沉淀后,再進(jìn)行免疫印跡來監(jiān)測的。然而,在免疫印跡步驟中,由于表位掩蓋、親和力降低或蛋白質(zhì)多泛素化導(dǎo)致的選擇性變化,底物抗體常常與底物的多泛素化形式產(chǎn)生不同的相互作用。

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1UbiTest檢測的示意圖:通過磁性TUBEs捕獲富集泛素化蛋白,然后從TUBEs中洗脫。分離的多泛素化洗脫液被分成兩部分:一部分保持未處理狀態(tài),而第二部分用廣譜去泛素化酶(DUB)消化以去除泛素鏈。兩部分均使用針對(duì)目標(biāo)蛋白(POI)的抗體進(jìn)行免疫印跡分析。從多泛素化POI上去除泛素鏈后,在免疫印跡中可以看到一個(gè)單一的、未修飾的POI條帶。

 

一種更明確的證明蛋白質(zhì)泛素化的方法是,在免疫印跡分析之前,將免疫沉淀與使用廣譜去泛素化酶(DUB)進(jìn)行去泛素化相結(jié)合。如果在經(jīng)過DUB處理后,目標(biāo)蛋白(POI)的信號(hào)增強(qiáng),這表明該蛋白即使在未處理的樣本中沒有明顯的反應(yīng)性,也已經(jīng)發(fā)生了泛素化。

 

LifeSensorsUbiTest檢測利用TUBEs(串聯(lián)泛素結(jié)合實(shí)體)來捕獲多泛素化蛋白,以避免由于POI免疫反應(yīng)性變化而可能出現(xiàn)的問題。TUBEs是經(jīng)過工程改造的串聯(lián)泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域,其與多泛素的解離常數(shù)在納摩爾范圍內(nèi)。LifeSensors的泛選擇性TUBEs已被證明能夠結(jié)合所有八種泛素連接類型。

 

為了確定目標(biāo)蛋白上多泛素化的連接類型,LifeSensors開發(fā)了一種更具針對(duì)性的方法,該方法在免疫印跡分析之前使用特定連接類型的DUB。如果在經(jīng)過K48/K63特異性DUB處理后,與未修飾POI對(duì)應(yīng)的條帶信號(hào)增強(qiáng),則表明該蛋白發(fā)生了K48/K63多泛素化。

 

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