離子色譜儀主要由流動相傳送部分、分離柱、檢測器和數據處理四大部分組成，分離原理也是通過流動相和固定相之間的相互作用，使流動相中的不同組份在兩相中重新分配。由于各組份在分離柱中的滯留時間有所區別，從而達到分離的目的。在將分離后的各個成分依次通過一高靈敏度的檢測器時就可檢測出各離子成分的濃度來，它具有GX、快速、準確的優點。
離子色譜儀的分類：
離子色譜是GX液相色譜的一種，是分析陰陽離子的一種液相色譜方法，該方法具有選擇性好、靈敏、快速、簡便等優點，并且可以同時測定多種組分。通常情況下，離子色譜可以分為三種類型：離子交換色譜、離子排斥色譜、離子對色譜。
1、離子交換色譜：以離子間作用力不同為原理，主要用于有機和無機陰、陽離子的分離；
2、離子排斥色譜：基于Donnan排隊斥作用，是利用溶質和固定相之間的非離子性相互作用進行分離的。它主要用于機弱酸和有機酸的分離，也可以用于醇類、醛類、氨基酸和糖類的分離；
3、離子對色譜：分離機理是吸附、分離的選擇性主要由流動相決定。該方法主要用于表面活性陰離子和陽離子以及金屬絡合物的分離。
日常使用維護：
離子色譜儀至少每隔3天通一次去離子水，隔七天通一次淋洗液，離子色譜柱每使用倆個月，需用0.2mol/L 的Na2CO3溶液及1%酒石酸溶液洗滌，以維持色譜柱的性能，色譜柱若長時間不用，則應通入3%的硼酸密封連同YZ器低溫保存，平流泵用去離子水沖洗干凈。淋洗液不可隔天使用，以免滋生細菌，影響色譜柱的使用壽命，為延長色譜柱的使用壽命，最好不用于工業廢水等污染較為嚴重的廢水的分析，若要使用，必須嚴格按照樣品的前處理方法對樣品進行預處理，使用過程中注意避免氣體、重金屬離子以及有機物進入色譜柱，引起色譜柱喪失部分能力，甚至損壞。
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