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兩種花青衍生物Cy3和Cy5亞磷酰胺是用于制備熒光標記的寡核苷酸的熒光標記試劑。 通常在5'末端添加一次花青染料，并且應在合成儀上除去MMT組。 MMT陽離子（黃色）的吸光度與DMT陽離子（橙色）明顯不同，因此三苯甲基吸光度可用于監測寡核苷酸偶聯。 花青染料亞磷酰胺也已成功地鄰近3'末端使用。 含有花青染料的寡聚物的脫保護可以在室溫下用氫氧化銨進行，而不管所用單體上的堿保護基團如何。 如果在升高的溫度下使用氫氧化銨，則Cy3和Cy3.5比Cy5和Cy5.5更穩定。 使用具有堿不穩定保護基團的單體以在脫保護期間將暴露時間限制在65℃下2小時或更短時間。

英文名稱：Cy3-Phosphoramidite

Cyanine3-Phosphoramidite

中文名稱：Cy3亞磷酰胺

CAS：182873-76-3

分子式：C58H70ClN4O4P

分子量： 953.65

保存方法： -20°C in the dark

結構式：

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