氦離子化氣相色譜儀經過長時間的使用后，分流管線的內徑逐漸變小，甚至*被堵塞。分流管線被堵塞后，儀器進樣口顯示壓力異常，峰形變差，分析結果異常。在檢修過程中，無論事先能否判斷分流管線有無堵塞現象，都需要對分流管線進行清洗。分流管線的清洗一般選擇丙酮、甲苯等有機溶劑，對堵塞嚴重的分流管線有時用單純清洗的方法很難清洗干凈，需要采取一些其他輔助的機械方法來完成。可以選取粗細合適的鋼絲對分流管線進行簡單的疏通，然后再用丙酮、甲苯等有機溶劑進行清洗。
氦離子化氣相色譜儀的原理是：樣品溶液進樣后，首先進入汽化室，然后在載氣的傳送作用下進入色譜柱(載氣常用氮氣或氦氣)，不同組分在色譜柱中被分離，依次流出色譜柱，被檢測器檢測，得到其含量。測定樣品中某組分的含量時，需要先分析已知濃度的標準樣品，然后將標準樣品色譜峰的保留時間和峰面積與待測樣品比對，計算待測樣品中目標組分含量。
依據檢測器的響應原理，可將其分為濃度型檢測器和質量型檢測器。
(1)濃度型檢測器：測量的是載氣中組分濃度的霎時變化，即檢測器的響應值正比于組分的濃度，如熱導檢測器、電子捕獲檢測器。
(2)質量型檢測器：測量的是載氣中所攜帶的樣品進入檢測器的速度變化，即檢測器的響應信號正比于單位時間內組分進入檢測器的質量。如氫焰離子化檢測器和火焰光度檢測器。
在氦離子化氣相色譜儀測定中，溫度控制是重要的指標，直接影響柱的分離效能、檢測器的靈活度和穩定性，溫度控制系統主要指對氣化室、色譜柱、檢測器三處的溫度控制。在氣化室要保證液體試樣霎時氣化；在色譜柱室要控制分離需求的溫度，當試樣復雜時，柱溫溫度需求按一定程序控制溫度變化，各組分在溫度下分離；在檢測器要使被分離后的組分經過時不在此冷凝。
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