生物發酵罐的種類很多，如機械攪拌式發酵罐、鼓泡發酵罐、液體循環式發酵罐等。
1、機械攪拌式發酵罐
可分為通風式發酵罐、自吸式發酵罐等。機械攪拌通風發酵罐是發酵設備中常用的一種類型。機械攪拌通風發酵罐是一種密封壓力設備，主要由罐體、軸封、消泡劑、攪拌器、聯軸器、中間軸承、擋板、供氣管、換熱器、井筒、管道等組成。
（1）通風發酵罐：通風發酵罐被稱為通用發酵罐，是工業上常用的微生物反應器。其優點是發酵液的pH值和溫度容易控制，適合于連續培養。其缺點是在絲狀菌的培養過程中，細胞容易被破壞。
（2）自吸式發酵機不需要空氣壓縮機來供應壓縮空氣。自吸式發酵機利用攪拌器產生的負壓來吸進空氣。其優點是攪拌和供氣都由機械攪拌器完成。缺點是吸氣范圍不大，對無菌要求高的發酵不適合，因為空氣在攪拌時進入發酵機，不適合厭氧發酵。
2、鼓泡發酵罐
鼓泡生物發酵罐借助于氣泡空氣提供攪拌和傳質所需的動力。鼓泡發酵罐具有結構簡單、成本低、耗電少等優點，減少了絲狀菌培養的危害。鼓泡發酵罐一般適用于低粘度、低固體含量、低耗氧量的發酵過程。
3、液體循環發酵罐
液體循環發酵罐有兩種：氣升式發酵罐和噴嘴環式發酵罐。
（1）氣升式發酵罐：氣提發酵罐與氣泡發酵類似，沒有機械攪拌，但罐外安裝有外循環管道。氣舉發酵罐具有結構簡單、成本低、能耗低等優點。櫸木發酵罐一般適用于低粘度、低固體含量的介質。
（2）噴嘴循環發酵罐：噴嘴循環生物發酵罐利用機械泵排出壓縮空氣，在噴嘴處形成剪切力場，將注入的空氣分散成液相中的小氣泡。與空氣提升發酵罐相比，噴嘴環形發酵罐的適用范圍更廣。
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