酵母菌細胞里含有豐富的蛋白質和維生素，可以做成營養品添加到食品中或做飼養動物的飼料等。酵母菌的保藏方法有兩種，一種是酵母菌保存于含有一定比例的甘油培養基中，在低溫或液氮中保存。另外一種是將酵母中加入脫脂奶粉等保護劑，進行凍干保存。酵母菌的用途主要在食用中可做食品及果蔬的添加劑，在嬰兒食品及健康食品中可做為營養強化劑。藥用中在酵母的培養過程中，添加一些特殊元素制成含硒，鉻等微量元素的酵母，對一些疾病有一些療效。在飼料中能促進動物的生長發育，改善肉質，增強禽畜的抗病能力。菌種的冷凍干燥的方法將先將要凍干的制品放置在-80℃的冰箱內預凍1-2小時，在將冷凍好的制品安瓿管放置于冷凍干燥機的干燥箱內，開始冷凍干燥，時間一般是8-24個小時，在抽真空干燥后，取出安瓿瓶，將安瓿瓶進行封口，封口時可選用五通管繼續抽氣，大約10分鐘達到26.7Pa,用煤氣噴燈的細火焰在管徑中央進行封口。后將安瓿瓶在-20℃的冰箱內保存。
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