水質在線分析儀在水質監測的實際工作中得到廣泛的應用，不但提高了湖泊、海洋的水體質量，同業也提高的飲用水的質量。為水質監測工作者帶來了便利，為了保證水質在線監測儀的使用壽命，儀器的維護可以幾個方面進行：定期校驗、多點線性檢驗以及定期清洗等。
根據儀器的校準周期，及被檢測水體的水質狀況來確定校準周期，如果水質狀況較差，則儀器的校準周期就應該相應縮短。根據實際生產情況，在線監測儀器每月校準一次基本能夠滿足要求，一般不能超過儀器說明書規定的期限。儀器如果長時間停機后重新啟動、更換電極、泵管等或更換不同批號的試劑等情況，則必須進行儀器的校準實驗。
在儀器線性范圍內均勻選擇4-6個濃度的標準溶液進行測試，并計算其斜率和相關系數。如果發現標準曲線的斜率和相關系數發生顯著的變化，在確保試劑質量以及非人為因素的前提下，應對監測儀器的性能進行檢查。對儀器標準曲線的多點線性檢驗，一般每半年進行一次即可，可保證儀器處于良好運行狀態。
水質在線分析儀本身一般具備在線清洗的功能，但如果水質較差，水中含有大量懸浮物質，隨著時間的推移，采水和配水管路、反應池、傳感器、電極和蠕動泵管等處會出現沉積物，會導致傳感器靈敏性產生變化，或影響樣品、試液注入到反應池中的體積，使檢測分析儀器測定的結果產生偏差。
定期清洗維護可減少偏差，使誤差有效地控制在范圍之內。對管路以及傳感器、蠕動泵管等進行清洗或更換后，對儀器進行重新標定，使系統始終處于良好的狀態，保證監測數據的可靠性。同時，也可以適當延長儀器的使用壽命，可以提高監測準確性，使其數據具有代表性，同時，實現長周期有效平穩運行，為水質的監測工作提供更科學的指導。
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