就熒光顯微鏡而言，激發濾光片，二向色鏡以及發射濾光片通常包含在同一立方體內，通常被設計來匹配特定熒光團或熒光蛋白的光譜。偶爾情況下，濾光片也可能不在立方體內，但會安裝在一個轉輪（稱為濾光片轉盤）上。
濾光片輪盤您可以混合搭配，盡可能匹配所需要的激發和發射波長。其終目標是捕獲到您希望從結合靶標的熒光基團光束上捕獲的光信號，同時漏過系統其它部分的任何光線（環境光，激發光源等）。
熒光成像使用的濾光片有哪些類型呢？
通常情況下，濾光片組被設計成可用于捕獲制定熒光團的大激發和發射波長，但不會捕獲所有的熒光。
多數現代化濾光片組的設計旨在確保激發濾光片允許制定波長區間的光線通過。這種類型的濾光片稱為帶通濾光片。
帶通濾光片通常通過中間波長和區間寬度確定。在較為簡單的熒光顯微鏡裝置中，一旦激發光線離開激發濾光片，即會照射到靶標上，靶標上的熒光激團隨即變為激發狀態，然后發射向光譜的紅外端（相對于激發光線）遷移的光線，并非所有此類發射光線都會被檢測器捕獲到——僅哪些允許通過二向色鏡且能通過發射濾光片的光線。
發射濾光片通常為帶通濾光片或者長波通濾光片，具體取決于特定的熒光團和成像實驗。如果您希望讓超過特定波長的光線通過檢測器，可選擇長波通濾光片
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