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T4 gene32蛋白在RPA中作用機制

時間:2023/11/14閱讀:312
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T4 gene32蛋白來源于T4噬菌體,屬于單鏈DNA結合蛋白家族,是T4噬菌體的一種單鏈DNA結合蛋白,在RPA技術中發揮輔助作用。T4 gene32蛋白具有三個OB折疊結構域,可識別并與單鏈DNA forma化學鍵結合,但與雙鏈DNA的結合力較弱。T4 gene32蛋白是RPA技術實現等溫擴增的一種輔助因子。它可保護單鏈DNA,促進引物退火,并與其他關鍵酶協同作用,提高RPA反應的效率與靈敏度,實現低豐度核酸的快速檢測。


規格參數:

RAA凍干顆粒產品:

HP80201 基礎型RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80202 熒光型RAA 核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80203 基礎型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80204 熒光型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80205 試紙條型RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)

HP80206 試紙條型RT-RAA核酸擴增試劑(凍干顆粒)


RPA原料:

EH04401 DNA重組酶 Recombinase A

EH03201 Bst DNA聚合酶 Bst DNA polymerase

EH04801 核酸外切酶 IV Exonuclease IV

EH04701 核酸外切酶 III Exonuclease III

EH02501 M-MuLV反轉錄酶 M-MuLV Reverse Transcriptase

EH03301 Bsu DNA聚合酶大片段 Bsu DNA polymerase, Large Fragment

EH04501 重組肌酸激酶(CK) Creatine Kinase

EH03501 T4 UvsX重組酶 T4 UvsX Recombinase

EH03401 T4噬菌體基因32編碼蛋白(gp 32) T4 gene 32 Protein

EH03601 T4 UvsY蛋白 T4 UvsY Protein

HM0058 重組鼠源RNase抑制劑(40 U/µL) RNase Inhibitor


工作機理:

(1)保護單鏈DNA

在雙鏈DNA初變性后,T4 gene32蛋白可快速識別并且結合單鏈DNA,形成穩定的蛋白-DNA復合體,以防止單鏈DNA的二次結構形成和再次回環。這為后續的引物退火和延伸創造條件。

(2)促進引物退火

T4 gene32蛋白可通過與單鏈DNA的非特異性結合穩定其構象,使引物更易于與模板退火,這有利于RPA反應的啟動。

(3)放置與替換

一旦引物-模板雙鏈體形成并進展到延伸階段,T4 gene32蛋白被逐漸替換,以露出更多的單鏈DNA供聚合酶使用。這一替換過程需要消耗一定的能量。

(4)回收利用

在RPA反應結束時,尚未結合的T4 gene32蛋白可被回收利用,這降低了RPA成本,有利于其商業化開發。


作用機制:

T4 gene32蛋白主要通過兩種機制發揮作用:

(1)非特異性單鏈DNA結合

T4 gene32蛋白可快速識別和非特異性地結合單鏈DNA,以穩定其構象和防止回環。

(2)與其他蛋白的協同作用

T4 gene32蛋白還可與T4 UvsX Recombinase、T4 UvsY蛋白發生相互作用,協同地發揮作用,如促進引物退火和加速替換等,提高RPA反應的效率。


T4 gene32蛋白是RPA技術中主要應用如下:

1. 提高RPA反應效率

T4 gene32蛋白可保護單鏈DNA,促進引物退火,并與其他關鍵酶協同作用,這可提高RPA反應的效率和靈敏度,實現更高效的等溫擴增。

2. 商業RPA試劑盒

一些商業RPA試劑盒中的單鏈DNA結合蛋白成分包含T4 gene32蛋白,如TwistDx的Recombinase Polymerase Amplification kit等。這可提高試劑盒的性能和靈敏度。

3. 低豐度靶核酸檢測

T4 gene32蛋白的作用可提高RPA技術對低豐度DNA/RNA的檢測靈敏度,滿足某些樣本極低濃度下的檢測需求。

4. 實現細胞核內檢測

T4 gene32蛋白保護的單鏈DNA更易于T4 UvsX Recombinase識別和結合,這有利于實現RPA對細胞核內DNA和RNA的檢測。

5. 病原體低豐度快速檢測

聯合使用與特定病原體高度同源的引物,T4 gene32蛋白及RPA技術可實現病原體極低豐度的快速檢測,應用于某些病原體感染的診斷,如病毒感染的診斷。

6. 微生物快速檢測

設計與特定微生物同源的引物,聯合T4 gene32蛋白及RPA技術,可實現相關微生物DNA/RNA的快速檢測,滿足環境監測、食品安全等領域的需求。

7. miRNA快速檢測

利用與特定miRNA高度同源的引物,聯合T4 gene32蛋白及RPA技術,可實現細胞miRNA的快速靈敏檢測,滿足miRNA功能研究與開發miRNA生物標記物的需求。

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