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Nature Methods:新的亮紅色熒光蛋白

時間:2024/6/12閱讀:616
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摘要:熒光蛋白被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究,使各種類型的細(xì)胞或結(jié)構(gòu)可見。例如,與癌癥有關(guān)的干細(xì)胞或蛋白質(zhì)。由Dorus Gadella領(lǐng)導(dǎo)的阿姆斯特丹大學(xué)研究小組開發(fā)了一種新的鮮紅色熒光蛋白:mScarlet3。
為了理解一個細(xì)胞分裂、分泌激素或向另一個細(xì)胞傳遞信號的原因,生物學(xué)家經(jīng)常使用一個技巧。他們在感興趣的蛋白質(zhì)上安裝了彩色的“燈",這樣他們就可以在顯微鏡下跟蹤這些蛋白質(zhì)在活細(xì)胞中的運動和相互作用。這些“燈"的顏色越多,它們可以同時遵循的過程就越多。
在20世紀(jì)90年代,科學(xué)家們首(空)次在細(xì)胞中使用熒光蛋白作為彩色標(biāo)記。這種蛋白質(zhì)是綠色的,來自熒光水母。通過對綠色蛋白質(zhì)進(jìn)行修補(bǔ),藍(lán)色、綠松石和黃色的變體出現(xiàn)了。21世紀(jì)初,在珊瑚中發(fā)現(xiàn)了一種紅色熒光蛋白。但事實證明,將這種蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)化為可用于細(xì)胞研究的明亮紅光更具挑戰(zhàn)性。
阿姆斯特丹大學(xué)研究小組開發(fā)了一種新的鮮紅色熒光蛋白:mScarlet3
圖1 阿姆斯特丹大學(xué)研究小組開發(fā)了一種新的鮮紅色熒光蛋白:mScarlet3
創(chuàng)建mScarlet3
2016年,阿姆斯特丹大學(xué)生物學(xué)家Dorus Gadella的團(tuán)隊成功地創(chuàng)造了一種新的亮紅色熒光蛋白,實現(xiàn)了巨大的飛躍。他們將這種蛋白質(zhì)命名為mScarlet。它們的紅色發(fā)光蛋白質(zhì)很快被科學(xué)界發(fā)現(xiàn)。編碼mScarlet的DNA已被請求約3400次,現(xiàn)在幾乎世界上每個國家都將其用于細(xì)胞生物學(xué)研究。
不幸的是,在哺乳動物細(xì)胞中,mScarlet蛋白被證明比常用的綠色熒光蛋白折疊得更慢,更不完(空)全,導(dǎo)致這些細(xì)胞的亮度不是最佳的。因此,該團(tuán)隊繼續(xù)研究這種蛋白質(zhì),并試圖加速和最(空)大化折疊。他們使用了他們已經(jīng)開發(fā)的兩種mScarlet變體,一種折疊速度快,但亮度較低,另一種折疊速度慢,但最終熒光明亮。他們試圖將這兩種蛋白質(zhì)的積極特性結(jié)合到一種新的蛋白質(zhì)中。在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的一些有針對性的改變的幫助下,他們成功地實現(xiàn)了這一點,產(chǎn)生了mScarlet3。這個最新的變種現(xiàn)在結(jié)合了最大的亮度,快速和完整的折疊。
最后,為了測試mScarlet3的結(jié)構(gòu),生物學(xué)家們把他們的作品送到了格勒諾布爾的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究所(CNRS, CEA, Université格勒諾布爾阿爾卑斯)。結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Antoine Royant使用歐洲同步加速器ESRF(最(空)亮的x射線源)來繪制蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)。Royant:“事實證明,mScarlet3之所以如此明亮,是因為這種蛋白質(zhì)中有一種特殊的疏水(油性)局部結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)既加快了蛋白質(zhì)的折疊速度,也改善了蛋白質(zhì)的折疊速度。"
在HeLa細(xì)胞中作為融合標(biāo)簽的RFPs的評估
圖片:在HeLa細(xì)胞中作為融合標(biāo)簽的RFPs的評估。
新標(biāo)準(zhǔn)
有了這種新的、大大改進(jìn)的紅色熒光蛋白,科學(xué)家們在實驗室里的工具箱現(xiàn)在比以往任何時候都更完整。加德拉:“使用mScarlet的經(jīng)驗已經(jīng)非常積極,這就是為什么我們預(yù)計mScarlet3將在研究人員中更受歡迎,并將迅速成為全球的新標(biāo)準(zhǔn)。鮮紅色熒光蛋白受到高度追捧,因為激發(fā)這些紅色蛋白比激發(fā)綠色蛋白對細(xì)胞的危害小。此外,紅光散射較少,這意味著你也可以用顯微鏡觀察更深層次細(xì)胞的分子過程。有了mScarlet3,我們終于有了一種非常健壯的亮紅色熒光蛋白,它折疊迅速而完(空)全,沒有進(jìn)一步的缺點。我們對mScarlet3的新應(yīng)用有很多期待,包括制作新的紅色熒光生物傳感器,mScarlet3可以用來對特定的細(xì)胞功能進(jìn)行成像。"
mScarlet3的遺傳密碼已被UvA申請專(空)利。
參考資料:
[1] Platelet glycoprotein V spatio-temporally controls fibrin formation

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