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技術文章

NuSmart®在FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)鑒定中應用

閱讀:505          發布時間:2024-9-4

NuSmart®FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)鑒定中應用

——無需脫蠟、一片即結果

 

FFPE是"福爾馬林固定、石蠟包埋"(Formalin-Fixed and Paraffin-Embedded)的縮寫,是一種常見的組織樣本保存方法。在醫學研究和臨床診斷中,FFPE可用于組織學檢查、病理診斷和分子分析。而FFPE在分子分析中的應用主要包括:

1、癌癥研究FFPE樣本常用于癌癥基因組學研究,包括突變分析、拷貝數變異檢測等。

2、基因表達分析:FFPE樣本中的RNA可用于基因表達分析,了解疾病相關基因的表達模式。

3、DNA甲基化分析:FFPE樣本可用于研究DNA甲基化狀態,探索與疾病相關的表觀遺傳學改變。

4、miRNA分析:FFPE樣本中的miRNA可用于研究其在疾病發生發展中的作用。

5、生物銀行和歷史樣本研究:利用存儲的歷史FFPE樣本進行生物標志物的發現和驗證研究。

愿望是美好的,現實是提取FFPE中DNA存在很多“痛處",例如

1、DNA損傷和化學修飾:福爾馬林固定導致DNA發生化學修飾,如堿基脫嘌呤、鏈間交聯等。

2、DNA片段化:FFPE樣本中的DNA通常已部分降解,形成較小的片段,這可能影響某些需要較長DNA片段的實驗。

3、DNA與蛋白質的交聯:DNA可能與組蛋白等蛋白質緊密交聯,增加了提取和純化的難度。

4、樣品質量控制:組織脫水、固定延遲或時間過長等因素都會損害標本質量。

5、DNA提取效率:目前市場的FFPE提取試劑盒性能差異很大,提取時間和提取效率都有很大不同。

6、PCR抑制劑:FFPE樣本中可能存在PCR抑制劑,影響后續的PCR擴增反應。

NuSmart®技術wan美解決以上痛點,NuSmart®FFPE樣本PCR試劑盒提供了FFPE Buffer用于將切片中組織DNA釋放出來,高耐受力的2× FFPE Smart Mix能夠抑制常見干擾劑。總結來看有以下特點:

—1-2片切片就有結果

—操作簡單,無需脫蠟

—操作便捷,僅需要10分鐘

—僅需要加熱處理

—無需配備昂貴設備

 

操作流程

圖片1.png

 

 

 

案例 不同組織切片擴增8對引物

圖片2.png

 

1、肝 2、肺 3、胃

 

使用NuSmart®FFPE樣本PCR試劑盒(貨號Nu-FFPE0101)處理肝、肺、胃三組切片,使用2× FFPE Smart Mix8對引物

 

 

 

 

 

 


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