獨立式紅外顯微鏡直觀的軟件引導用戶完成紅外顯微鏡的測試過程。左側窗口中的功能條顯示下步可選的操作，中心窗口顯示相機采集的實時樣品圖像，右邊窗口顯示已采集的可見光圖像。
樣品測試點可以是連續的點、線、面或者是不連續的點(可在實時圖像上顯示)。用戶可在任何感興趣的位置進行標記和注釋。
下面讓我們一起來了解一下獨立式紅外顯微鏡的工作流程與軟件
LUMOS是由OPUS紅外軟件控制，簡單易用，功能強大。諸如數據采集、數據處理、數據評估和數據報告等功能都可以在OPUS中完成。
OPUS-Video會指導用戶一步一步完成數據采集過程。通過用戶界面，使用者可以進行可見光區的觀察，設置樣品測試點、空間分辨率和采集時間，確定測試模式，后開始自動測試。
OPUS-Video每次僅顯示下一步可能使用的功能，保證了測試流程的簡單性和高效性。LUMOS所有的部件均由計算機自動控制，無論是透射、反射還是ATR模式，都可自動完成背景測試和樣品測試。
所有的測試結果會自動保存在一個文件中，該文件包括可見光圖像、光譜數據、樣品信息和實驗參數等。用戶可以在OPUS 軟件中調入這些文件進行處理。
面掃描和化學成像數據也可以很容易的在OPUS軟件中用單變量和多變量方法加以處理和評估。用戶可將紅外化學成像和可見光的2D/3D圖像排列在一起進行對比和分析。
紅外數據可以采用多種方法進行處理，如積分特定波段、3D聚類分析、主成分分析(PCA)等，確定化學組成或研究樣品表面的分布均勻性。
在面掃描或者成像數據的紅外譜圖上直接點擊右鍵，用戶可以進行譜庫檢索，以確定所關心的未知化合物的化學結構。
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