使用低溫恒溫槽時，如果使用的載冷劑是用酒精或乙二醇水合物的話，需要注意蓋好蓋子，防止高溫時載冷劑迅速蒸發，低溫時吸收空氣中的水份出現冰凍，還可以防止灰塵等其他雜質進入。還需要做好控溫設備的防護，防止對循環劑造成的污染。
在確保低溫恒溫槽不會被污染的情況下，要隨時注意載冷劑的變化，通常低溫恒溫槽都會有液位報警，如果儀器報警，要及時添加載冷劑。
溫恒溫槽使用硅油時，也是要蓋好蓋子，防止高溫時蒸發出的煙，低溫時吸收水份，如果硅油吸水了的話，可以在70-80度下蒸2-6個小時，把水蒸出來，通常情況下，質量好的硅油正常使用可以用很長時間。
低溫恒溫槽在高溫時如果不方便蓋上浴槽蓋，那么蒸發會很嚴重，這時可以用附浮球防止蒸發的原理，把浮球浮在液體表面，這樣如果鋪上很多浮球，蒸發面積就小了，一般可以減少90%的蒸發，另外浮球相當于一層隔熱層，可以起到保溫的作用，還可以防止外界的氧氣等進入到浴液里面，起到低溫恒溫槽浴液防護作用。
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