微生物快速鑒定質譜一般由樣品導入系統、離子源、質量分析器和檢測器組成，此外，還含有真空系統和控制及數據處理系統等輔助設備。由于質譜儀質譜儀工作原理不同，又有四極質譜儀、飛行時間質譜儀、離子阱質譜儀等。
微生物快速鑒定質譜的質量范圍是能測定離子質荷比的離子質量范圍。不同用途質譜儀器的質量范圍相差很大，穩定同位素氣體質譜儀的質量范圍通常在1～200之間；固體質譜儀的質量范圍大都在3～380之間；有機質譜儀的質量范圍從幾千到幾萬不等，甚至更高。
現在質譜分析中質量范圍大的質譜儀是基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜儀該種儀器測定的分子質量可高達10000以上。
質譜儀可分辨相鄰兩個質譜峰的能力，廣義以R＝M△M來度量M為可分辨兩個質譜峰的質量平均值：△M為可分辨的兩個質譜峰的質量差。實際上，可分辨的兩個質譜峰允許有一定重疊，使用時應注明重疊程度。
準確度指測量結果與被測量真值或約定真值間的一致程度。隨著真空、材料、電子學及計算機技術的快速發展，越來越多的新技術被用在質譜儀器上，使得質譜儀的各項性能指標都取得了顯著提高。
進樣方式：
1、儲罐進樣：低沸點的樣品，將其氣化并導入抽真空的加熱氣罐中，以恒定的流速由儲罐通過一個小孔(分子漏孔)導入離子源。
2、探頭進樣：單組分、揮發性較低的液體或固體樣品，可在高真空條件下，用進樣桿把樣品通過真空閉鎖裝置送入離子源中被加熱氣化，并被離子源離子化。
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