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57次多肽測序是指確定多肽或dànbáizhì分子中氨基酸殘基的順序的過程。這一過程對于dànbáizhì結(jié)構(gòu)和功能的研究至關(guān)重要,因?yàn)榘被嵝蛄兄苯記Q定了dànbáizhì的三維結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能。多肽測序主要依賴于質(zhì)譜(Mass Spectrometry, MS)技術(shù),尤其是串聯(lián)質(zhì)譜(Tandem Mass Spectrometry, MS/MS)技術(shù)。
圖1. 通過質(zhì)譜法進(jìn)行肽從頭測序的過程
質(zhì)譜測序原理
多肽的離子化
在質(zhì)譜分析中,首先需要將多肽樣品離子化。離子化是將多肽分子轉(zhuǎn)換為帶電粒子的過程,這一步驟對于后續(xù)的質(zhì)譜檢測至關(guān)重要。常用的離子化方法包括電噴霧離子化(Electrospray Ionization, ESI)和基質(zhì)輔助激光解吸/電離(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization, MALDI)。
離子的分離
離子化后的多肽離子會被送入質(zhì)譜儀中,通過質(zhì)量分析器進(jìn)行分離。質(zhì)量分析器根據(jù)離子的質(zhì)荷比(m/z)對它們進(jìn)行分離。常見的質(zhì)量分析器有時間飛行(Time-of-Flight, TOF)、離子阱(Ion Trap)和傅里葉變換離子回旋共振(Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance, FT-ICR)等。
多肽的碎片化
在MS/MS分析中,選定的前體離子(即特定m/z比的多肽離子)會被進(jìn)一步碎片化。碎片化是指在控制條件下使多肽離子斷裂,產(chǎn)生一系列代表多肽序列信息的小片段離子。常用的碎片化技術(shù)包括碰撞誘導(dǎo)解離(Collision-Induced Dissociation, CID)、電子轉(zhuǎn)移解離(Electron Transfer Dissociation, ETD)和光子誘導(dǎo)解離(Photon-Induced Dissociation, PID)等。
碎片離子的檢測
碎片化產(chǎn)生的離子片段隨后會被送入第二個質(zhì)量分析器中進(jìn)行檢測和分析。通過分析這些碎片離子的m/z值,可以獲得有關(guān)多肽氨基酸序列的信息。
序列分析和鑒定
zuì后,利用生物信息學(xué)軟件和數(shù)據(jù)庫匹配技術(shù),根據(jù)碎片離子的質(zhì)荷比和模式,推斷出原始多肽的氨基酸序列。這一步通常涉及到與已知dànbáizhì數(shù)據(jù)庫的比對,以鑒定未知多肽或dànbáizhì的序列。
多肽測序的準(zhǔn)確性和成功率受多種因素影響,包括樣品的純度、離子化效率、碎片化方法以及質(zhì)譜儀的分辨率和準(zhǔn)確性。隨著質(zhì)譜技術(shù)的不斷發(fā)展和優(yōu)化,多肽測序已成為dànbáizhì組學(xué)和生物分子研究中bùkěhuòquē的工具
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