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dànbáizhì下拉實驗(Protein Pull-Down Assay)是廣泛用于研究dànbáizhì-dànbáizhì相互作用的技術,通過使用特定的標記dànbáizhì捕捉與其相互作用的其他dànbáizhì,進而分析dànbáizhì間的相互關系。dànbáizhì下拉實驗主要用于驗證dànbáizhì-dànbáizhì相互作用,鑒定與特定dànbáizhì結合的相互作用伙伴,甚至可以在一定程度上揭示其相互作用的親和力和結合特性。與酵母雙雜交、免疫共沉淀(Co-IP)等方法相比,dànbáizhì下拉實驗在體外環境下進行,能較為直接地捕獲dànbáizhì間的特異性相互作用。同時,因其操作簡便、靈敏度高以及能夠揭示直接相互作用的優勢,成為研究dànbáizhì-dànbáizhì相互作用的常用方法之一。它應用于細胞信號傳導、疾病機制研究、藥物靶點發現等領域。隨著質譜技術和高通量數據分析的發展,dànbáizhì下拉實驗逐漸向高通量篩選和全蛋白組水平的相互作用網絡分析邁進。通過結合定量質譜技術(如iTRAQ、TMT標記),科研人員可以在更大范圍內識別和分析dànbáizhì-dànbáizhì相互作用,揭示更多生物學意義。同時,利用dànbáizhì下拉實驗與其他技術(如表面等離子體共振、免疫共沉淀)相結合,可以更全面地解析dànbáizhì相互作用的動態過程。
一、dànbáizhì下拉實驗的基本原理
dànbáizhì下拉實驗的核心原理是利用一種標記的“誘餌蛋白"(Bait Protein)作為固定化配體,通過與細胞裂解液或純化dànbáizhì溶液中的目標蛋白相結合,隨后將結合復合物從溶液中分離并進行檢測。誘餌蛋白通常與固相載體(如瓊脂糖珠、磁珠等)結合,常見標記包括GST(gǔguānggāntàiS轉移酶)、His標簽、FLAG標簽等。
二、實驗流程
1、固定化誘餌蛋白
將含有標簽的誘餌蛋白固定在固相載體上。
2、孵育與結合
將目標dànbáizhì(來源于細胞裂解液或純化dànbáizhì樣品)與固定化的誘餌蛋白孵育,使其發生結合。
3、洗滌
去除非特異性結合的dànbáizhì,確保僅保留特異性相互作用的dànbáizhì復合物。
4、洗脫與檢測
使用SDS-PAGE、Western Blot或質譜分析等技術對下拉的dànbáizhì進行鑒定和分析。
三、dànbáizhì下拉實驗的應用
1. 驗證dànbáizhì-dànbáizhì相互作用
dànbáizhì下拉實驗常用于驗證在高通量篩選(如酵母雙雜交或免疫共沉淀)中發現的潛在相互作用伙伴。通過在體外進行jīngquè定量分析,可以判斷兩種dànbáizhì之間是否存在直接相互作用。
2. 篩選新的結合伙伴
通過使用特定的誘餌蛋白,可以從復雜的細胞裂解液或組織樣本中捕獲新的結合dànbáizhì,幫助識別未知的dànbáizhì-dànbáizhì相互作用。
3. 分析dànbáizhì相互作用的結合域
通過構建不同截短形式的誘餌蛋白或目標蛋白,可以確定dànbáizhì之間相互作用的關鍵結構域或氨基酸位點。
4. 研究相互作用的調控機制
dànbáizhì下拉實驗還可以用于研究相互作用在不同生理條件(如不同pH值、離子濃度或藥物處理)下的變化,揭示調控機制。
四、dànbáizhì下拉實驗的技術要點
1、誘餌蛋白的選擇
(1)確保誘餌蛋白是正確折疊的、具有生物活性的。
(2)合理選擇標簽類型(如GST、His、FLAG等)和結合載體。
2、非特異性結合的控制
(1)設置適當的陰性對照(如空載體或不含誘餌蛋白的載體)。
(2)優化洗滌條件,減少非特異性結合。
3、dànbáizhì純化與洗滌
(1)純化dànbáizhì要確保較高的純度,避免其他dànbáizhì的干擾。
(2)洗滌步驟要足夠嚴格,以排除非特異性結合,同時避免過度洗滌導致目標蛋白丟失。
百泰派克生物科技在dànbáizhì下拉實驗領域擁有豐富的經驗和技術積累,能夠為客戶提供全面的dànbáizhì相互作用研究解決方案。我們的服務包括實驗設計、dànbáizhì純化、誘餌蛋白固定化、下拉實驗執行以及后續的Western Blot或質譜分析。無論是驗證特定的dànbáizhì相互作用,還是進行大規模的結合蛋白篩選,百泰派克都能夠提供高質量的實驗數據和科學見解,幫助科研人員加速研究進程,揭示dànbáizhì相互作用的分子機制。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
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百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白zhìzǔxué、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白zhìzǔxué分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白zhìzǔxué服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
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2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
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北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
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