LC-MS/MS 如何助力Bottom-Up蛋白質組學？檢測技術服務詳情介紹

Bottom-Updànbáizhì組學通過將復雜dànbáizhì樣本酶解成肽段，再借助液相色譜-串聯質譜（LC-MS/MS）進行分析，以實現dànbáizhì的全面鑒定與定量。這yìliú程不僅提高了蛋白組學研究的靈敏度和通量，也為探索疾病機制、生物標志物發現、藥物靶點篩選等領域提供了技術保障。

一、LC-MS/MS的基本原理與優勢

1、什么是 LC-MS/MS？

LC-MS/MS 是液相色譜（Liquid Chromatography）與串聯質譜（Tandem Mass Spectrometry）的組合系統，能高效分析復雜生物樣本中的蛋白衍生肽段。在該系統中，液相色譜首先對肽段進行分離，降低樣品復雜度；隨后質譜系統通過電噴霧電離（ESI）將肽段轉化為帶電離子，并在一級質譜（MS1）中進行質量檢測，再選擇特定肽離子進行碎裂，進入二級質譜（MS2）分析其碎片離子，以此推測肽段序列，反推出對應的蛋白信息。

2、為什么LC-MS/MS是Bottom-Up的核心？

LC-MS/MS在Bottom-Updànbáizhì組學中的地位bùkětìdài，主要體現在以下幾個方面：

（1）高靈敏度與廣譜性：可在復雜背景中識別低豐度蛋白，特別適用于探索型研究和疾病機制解析。

（2）高分辨率分離能力：結合納升級液相色譜和高分辨 Orbitrap 或 TOF 質譜，可實現肽段的jīngzhǔn定性與定量。

（3）支持多種定量策略：無論是標簽定量（TMT、iTRAQ）還是無biāojìdìng量（LFQ、DIA），LC-MS/MS 均能兼容并提供穩定結果。

（4）兼容翻譯后修飾檢測：如磷酸化、乙?；?、泛素化等，借助相應富集技術，LC-MS/MS 可實現修飾位點級別的解析。

二、Bottom-Updànbáizhì組學流程中的關鍵步驟

成功的dànbáizhì組分析始于高質量的蛋白提取。不同樣本類型（如細胞、組織、血液）對提取條件有不同需求。百泰派克采用多種裂解方案（RIPA、SDS、尿素裂解等）以及高效的雜質清除流程（如乙醇沉淀、FASP），確保蛋白zuì大程度溶解并兼容后續質譜分析。BCA 或 Bradford 法用于jīngquè定量，保證樣本間一致性。

在Bottom-Updànbáizhì組學流程中，蛋白需酶切為可被質譜識別的肽段。zuì常用的酶是yídànbáiméi（Trypsin），其特異性高、切割模式穩定。百泰派克通過jīngzhǔn控制酶與底物比例、反應時間與溫度，優化酶切效率并減少非特異性切割，提高蛋白鑒定覆蓋度。

酶切后的肽混合物中包含鹽、去污劑等干擾成分，需經固相萃?。⊿PE）等手段純化。隨后，通過高性能液相色譜（HPLC）系統對肽段進行分離，為質譜檢測創造有利條件。部分項目還可結合高 pH 反向分離實現肽段預分級，提升蛋白覆蓋率。

百泰派克搭載多款gāoduān質譜儀（如 Orbitrap Fusion Lumos、Q Exactive HF-X、timsTOF Pro），支持 DDA（數據依賴采集）、DIA（數據獨立采集）、PRM 等多種采集模式。我們根據實驗目標選擇合適方案，實現jīngzhǔn定量和全面鑒定。

質譜數據經 MaxQuant、Proteome Discoverer、Spectronaut 等平臺處理后，進行數據庫比對、蛋白定性、定量及修飾識別。百泰派克提供定制化生信分析服務，包括差異分析、GO/KEGG 注釋、PPI 網絡構建、富集分析等，幫助用戶深入理解蛋白表達變化背后的生物學意義。

三、應用場景：從基礎研究到轉化醫學

（1）疾病機制研究：比較病理狀態下的蛋白表達變化，挖掘潛在生物標志物

（2）藥物作用機制解析：觀察藥物干預前后的蛋白網絡變化

（3）植物和微生物蛋白組研究：適應復雜背景樣本的高通量分析

（4）翻譯后修飾研究：結合富集策略深入解析磷酸化、乙?；刃揎椖Ｊ?/strong>

百泰派克生物科技提供標準化的Bottom-Updànbáizhì組學服務，具備以下優勢：

• 多種質譜平臺選擇（Orbitrap、TripleTOF、TIMS-TOF）

• 完整的樣本到報告服務流程，適配多種研究需求

• 豐富的樣本經驗（人源、動物、微生物、植物）

• 嚴格的質控體系和zhuānyè的生信團隊，保障數據質量與可解釋性

LC-MS/MS 技術為 Bottom-Up dànbáizhì組學注入強大動力，讓我們能夠更深入地理解生命系統的動態變化。百泰派克生物科技依托優良的質譜平臺和成熟的前處理技術，致力于為科研人員提供高質量、可重復的Bottom-Updànbáizhì組學解決方案。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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