Top-Down蛋白質組學在腫瘤標志物發現中的五大應用檢測技術服務詳情介紹

腫瘤標志物作為癌癥診療的重要分子指標，長期依賴蛋白組學技術的支持。然而，腫瘤本質上是一種高度異質性的疾病，其關鍵蛋白往往具有豐富的翻譯后修飾（PTMs）和變異異構體（proteoforms）。這些精細分子特征常常在Bottom-Updànbáizhì組學中被忽略，制約了腫瘤標志物的發現深度與jīngzhǔn度。Top-Downdànbáizhì組學是一種直接分析完整dànbáizhì（而非肽段）的質譜技術，能夠保留dànbáizhì的翻譯后修飾（PTMs）、剪接變體和dànbáizhì異構體信息，通過直接分析完整dànbáizhì分子，實現dànbáizhì變體的全面解析，正成為破解腫瘤復雜性的重要工具。Bottom-Updànbáizhì組學雖然廣泛應用于腫瘤研究，但其“肽段為基礎"的策略難以保留完整dànbáizhì的信息，如剪切異構體、翻譯后修飾（PTMs）等，限制了其在jīngzhǔn標志物解析中的表現。相比之下，Top-Downdànbáizhì組學技術通過直接分析完整dànbáizhì分子，可在保持原始結構完整性的同時，jīngquè捕捉各種dànbáizhì異構體。這使其在腫瘤標志物發現中展現出dútè優勢。

一、解析dànbáizhì異構體，揭示腫瘤異質性本質

Top-Down技術能直接分析dànbáizhì的全長序列和PTM組合，識別同源蛋白的不同變體（proteoforms）。例如，p53蛋白的不同磷酸化、乙?；揎棤顟B在腫瘤發生發展中具有wánquán不同的功能意義。Bottom-Up方法無法jīngzhǔn識別這些差異，而Top-Down方法則可區分并量化這些功能性變體，助力揭示腫瘤細胞表型背后的分子機制。

二、靶向低豐度蛋白，提升早期診斷靈敏度

許多具有潛力的腫瘤標志物（如循環腫瘤細胞分泌的信號蛋白）豐度極低、異構體多。Top-Downdànbáizhì組學結合高分辨質譜與前處理富集策略，可在復雜背景下捕捉這些低豐度蛋白，尤其適用于血液、尿液等體液樣本，提升早期腫瘤篩查的特異性和靈敏度。

三、多位點修飾分析，賦能功能性標志物篩選

在癌癥進展中，許多關鍵蛋白同時攜帶多種翻譯后修飾（如磷酸化、泛素化、甲基化等）。Top-Down策略可同時解析這些修飾的空間組合，有助于區分“修飾指紋"對蛋白功能的調控，從而篩選出更具功能意義和臨床價值的候選標志物。

四、構建Proteoform圖譜，助力亞型分類與個體化治療

通過Top-Downdànbáizhì組學構建特定癌種的proteoform圖譜，有助于識別不同腫瘤亞型之間的關鍵分子差異。例如在乳腺癌研究中，不同proteoform模式已被用于區分ER陽性與HER2陽性亞型。這一策略為jīngzhǔn分型與靶向治療提供了分子依據。

五、結合AI算法，推動標志物大規模發現與驗證

當Top-Downdànbáizhì組數據與機器學習算法結合后，可在多組學背景中識別高價值生物標志物特征。數據驅動的模型不僅提高了候選標志物的識別效率，還提升了其跨平臺、跨人群的可重復性。隨著質譜技術的通量提升，Top-Down策略正逐步向臨床轉化邁進。

Top-Downdànbáizhì組學在腫瘤標志物研究中展現出結構解析深度高、修飾識別能力強、異構體區分精細等dútè優勢。作為一家專注于前沿蛋白組技術的科研服務企業，在百泰派克生物科技，我們整合高分辨率Orbitrap質譜平臺、定制化富集方案與AI輔助分析流程，打造面向科研與臨床轉化的Top-Downdànbáizhì組學服務體系。期待與您共同推進腫瘤jīngzhǔn醫學的發展。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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