氣相色譜柱是氣相色譜儀的核心部件之一。色譜柱常見的柱參數有：柱長、內徑、膜厚、固定相。
1、柱長：
10～15m通常十個組分以下簡單樣品的快速分析；
25～30m標準柱長滿足絕大部分應用；
50m，60m，100m復雜樣品的分析。
2、內徑：
0.53mm大口徑可替代填充柱能承受較大體積進樣，痕量分析；
0.32mm寬徑，分流/不分流進樣，能承受較大體積進樣；
0.25mm窄徑分流進樣，GC/MS應用，較高柱效；
0.18mm微徑較快分離高柱效；
0.10mm快速GC，快速分離對儀器要求高。
3、膜厚：
0.10um薄膜，保留和柱容量低適用于高沸點化合物、組分密集樣品或熱敏化合物0.25~0.50um標準膜厚應用廣泛；
1.0~10.0um厚膜保留和柱容量高，適用于低沸點揮發性化合物；
厚膜有利于掩蔽活性位點但高溫下柱流失較大。
4、固定相
當面對一個未知物時，先試用現有GC柱，如果該柱分離不理想，基本原則是分析物與固定相有相似化學性質時才會相互作用。這說明需要對樣品十分了解，就容易找到合適的固定相。
非極性分子——通常僅由C和H組成并且無偶極矩，直聯（正烷）是常見的非極性化合物的例子。
極性分子——主要由C和H組成同時也有其他原子，如:N、O、P、S或鹵素。樣品包括有醇類、胺類、硫醇類、酮類、有機鹵化物等。
可極化物質——主要由C和H組成同時包含不飽和鍵。通常有:炔和芳香族化合物。如果樣品是具有相似的化學性質的非極性組分的混合物，比如大多數石油餾分中的烴，可以試用按沸點順序分離的毛細管色譜柱。如果有芳族化合物，可試用有苯基的。
極性或可極化組分樣品能夠在中極性和/或可極化固定相色譜柱上進行分析，如有苯基或類似基團固定相。如需要更高極性的，可以選用聚乙二醇（PEG）固定相。
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