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賽默飛HRMS1-DIA方案驚艷亮相臨床蛋白質(zhì)組學和糖組學學術(shù)研討會!

閱讀:1716      發(fā)布時間:2019-5-28
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5月26日,CNHUPO|臨床蛋白質(zhì)組學和糖組學學術(shù)研討會于上海勝利閉幕。此次研討會,諸多蛋白組學和糖組學專家闡述了組學技術(shù)在醫(yī)學/臨床研究中的應(yīng)用,為未來從研究到臨床轉(zhuǎn)化探討了新的思路,開拓了更加廣闊的應(yīng)用前景。

北京生命科學研究院邵峰院士

報告題目:Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond

報告主要內(nèi)容:

大會由復(fù)旦大學陸豪杰教授致開幕詞,北京生命科學研究所邵峰院士做了題為“Innate immunity to cytosolic LPS:Pyroptosis and beyond”的報告,明晰了細胞焦亡與傳統(tǒng)細胞凋亡的區(qū)別,闡述了分子免疫機制:Caspase-4/5/11作為胞內(nèi)LPS的受體,識別LPS的Lipid A部分,進而發(fā)生寡聚化而激活。這些細菌免疫受體活化后,均通過誘導(dǎo)組裝炎癥小體復(fù)合物進而激活膜打孔蛋白GSDMD,誘發(fā)細胞焦亡。

 

復(fù)旦大學生物醫(yī)學研究院副院長楊芃原教授

報告題目:疾病糖蛋白質(zhì)組的定量質(zhì)譜

報告主要內(nèi)容:

從質(zhì)譜技術(shù)發(fā)展歷史,到質(zhì)譜如何幫助蛋白組學研究,再到質(zhì)譜技術(shù)未來向臨床發(fā)展的展望:以MRM為基礎(chǔ)的質(zhì)譜ELISA技術(shù)可以在臨床檢驗中逐步部分取代現(xiàn)有傳統(tǒng)ELISA,特別是檢驗具有群和網(wǎng)絡(luò)特征的關(guān)鍵蛋白。同時,運用Orbitrap技術(shù)的pGlyco 2.0提供給糖蛋白研究者又一有效的定量策略。

 

 

國家蛋白質(zhì)科學中心·北京秦鈞主任

報告題目:胃癌的臨床蛋白組學研究

報告主要內(nèi)容:

從蛋白質(zhì)組學應(yīng)用于臨床所面臨的問題,到未來蛋白質(zhì)組學走向臨床的前景,秦鈞教授通過一些臨床研究實例,講述了如何在實踐中逐步克服臨床生物樣本、檢測手段等方面的局限性,描繪了蛋白質(zhì)組學驅(qū)動轉(zhuǎn)化臨床的可行性。尤其是惡性腫瘤化療藥物靶點、免疫治療標志物、治療響應(yīng)性標志物等,有望應(yīng)用于臨床伴隨診斷。無論是在探索分子病理方面,抑或是實現(xiàn)臨床早診、治療領(lǐng)域,蛋白質(zhì)組學都發(fā)揮著越來越重要的作用。蛋白質(zhì)組學驅(qū)動的醫(yī)療時代(Proteomics-driven precision medicine)已經(jīng)被開啟。

 

  

同濟大學田志新教授

報告題目:基于糖蛋白質(zhì)組學的癌癥和癌癥干細胞生物標志物的分析

報告主要內(nèi)容:

同濟大學田志新教授,做了在肝癌、乳腺癌研究中發(fā)現(xiàn)N-糖蛋白質(zhì)標志物的報告,結(jié)合ZIC-HILIC富集、同位素二甲基標記、pentaHILIC-nESI-MS/MS(HCD,stepped NCEs)、GPseeker定性、GPseekerQuan定量,對HCC HepG2細胞中差異表達N-糖基化在完整水平上進行大規(guī)模位點和結(jié)構(gòu)特異性的分離、鑒定和定量。

 

 

西湖大學郭天南教授

西湖大學的郭天南教授介紹了運用DIA技術(shù)結(jié)合PCT快速樣品前處理技術(shù)在臨床大隊列樣本研究中的應(yīng)用,以及使用Orbitrap技術(shù)平臺建立人類多個組織蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)庫,為DIA和PRM分析提供便利。

 

賽默飛HRMS1-DIA方案廣受關(guān)注

大會報告中賽默飛應(yīng)用經(jīng)理周岳,帶來HRMS1-DIA技術(shù)在臨床大樣本蛋白質(zhì)組學分析中的可行性評價:

經(jīng)過來自9個國家和地區(qū)的11個實驗室,連續(xù)7天24小時運行,基于HRMS1-DIA工作流表現(xiàn)出長期運行中保持*的穩(wěn)定性,在不同儀器及實驗室間產(chǎn)生的數(shù)據(jù)也有重現(xiàn)性以及提供蛋白質(zhì)組學準確定量結(jié)果。HRMS1-DIA工作流可對醫(yī)學研究中的大隊列生物樣品進行高通量和深度的蛋白質(zhì)組定量。

 

HRMS1-DIA方案優(yōu)勢:

1相對傳統(tǒng)DIA的二級碎片離子定量,基于超高分辨一級全掃描的HRMS1-DIA定量蛋白和多肽的數(shù)量和準確性都有顯著提高(蛋白鑒定數(shù)目提高10%,CV<10%)

2在HRMS1-DIA工作流正常運行的狀態(tài)下,全部11個實驗室,平均可以鑒定到超過8000個蛋白(1% protein FDR),定量超過6000個蛋白。

3在定量準確性方面,在1小時定量6000個蛋白,50000個肽段的超高通量下,HRMS1-DIA工作流提供93%的定量準確性。

4超高80%的蛋白可以在每天、每個實驗室定量。

 

賽默飛HRMS1-DIA方案對于蛋白質(zhì)組學的臨床轉(zhuǎn)化具有極為廣泛的參考價值,超高的穩(wěn)定性、日間重復(fù)性成為臨床研究領(lǐng)域用戶值得期待的技術(shù)。

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